商铺收取租金的交税问题涉及多个税种和具体的计算方式，以下是对此问题的详细解答：

主要税种及计算

1. 房产税

   • 计税依据：基于房产的租金收入。
   • 税率：原本税率为12%，但自2019年1月1日起减半征收，因此实际税率为6%。
   • 计算方法：应纳税额等于租金收入乘以6%。

2. 个人所得税

   • 计税依据：来源于财产租赁的所得。
   • 税率：固定为20%。
   • 应纳税所得额计算：
     • 若每次收入不超过4000元，扣除800元费用后计算。
     • 若每次收入超过4000元，则扣除20%的费用后计算。
   • 计算公式：应纳税所得额等于（每次收入减去准予扣除项目和修缮费用）乘以（1-20%），应纳税额等于应纳税所得额乘以20%。

3. 增值税

   • 税率：一般为5%。
   • 计算方法：应纳税款等于含税销售额除以（1+5%）再乘以5%。
   • 特别规定：根据《国家税务总局关于增值税小规模纳税人减免增值税等政策有关征管事项的公告》，若采取一次性收取租金形式，且分摊后的月租金收入未超过10万元，则可免征增值税。

4. 城市维护建设税、教育费附加及地方教育附加

   • 计税依据：基于实际缴纳的增值税税额。
   • 税率：
     • 城市维护建设税根据地区不同，市区为7%，县城、镇为5%，其他为1%。
     • 教育费附加为3%。
     • 地方教育附加为2%。
   • 免征条件：若月销售额在10万元以下，可免征教育费附加和地方教育附加。

5. 印花税

   • 计税依据：基于租赁金额。
   • 税率：原本为千分之一，但自2019年1月1日起减半征收。
   • 特别规定：若税额不足1元，则按1元贴花。

6. 城镇土地使用税（如适用）

   • 计税依据：基于土地使用面积和单位税额。
   • 税率：具体税率由省、自治区、直辖市人民政府确定。
   • 减征政策：自2019年1月1日起减半征收。

注意事项

• 合同订立：确保租赁合同正式且经过工商备案认可，同时核验出租方的房屋产权证书原件和身份证件。
• 费用明确：在合同中清晰明确租金以外的其他费用承担方，包括税金、物业管理费、修缮费用等。
• 权益保障：合同中应明确承租人在租赁期间出租方出售或抵押商铺时的继续租赁权利，以及转租规定。
• 签字盖章：订立合同时，需所有权人和共有人同时到场签字盖章，不可由他人代替。

综上所述，商铺收取租金时涉及的税种较多，且具体税额和申报方式可能因地区和政策调整而有所不同。因此，建议纳税人在实际操作前咨询当地税务机关或专业税务顾问，以确保准确、及时地履行纳税义务，并保障自身合法权益。