关于员工把机器操作坏了怎么赔偿的问题，这需要根据具体的情况来判断，并遵循相关法律法规进行处理。以下是一个详细且深度的解答：
一、责任归属
故意或重大过失：
- 如果员工在操作机器过程中，明知某些行为可能导致机器损坏却故意为之，如故意违规操作、忽视安全警示等，或者因自身重大疏忽，如未按操作流程进行常规检查维护等，导致机器损坏，那么员工需要承担赔偿责任。
一般过失或意外：
- 如果员工在正常工作中，按照单位的操作规范和要求操作机器，已尽到自身应有的注意义务，而机器因自身质量问题、老化、意外情况（如突然停电、自然灾害等不可抗力）等原因出现故障或损坏，那么员工通常无需承担赔偿责任。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。
二、损失评估
维修费用：
- 需要联系专业的维修人员或机构对机器进行全面检查，确定准确的维修成本，包括零部件费用、人工费用等。
更换成本：
- 如果机器损坏严重，维修不经济或无法修复，应考虑更换新机器的费用，包括购买价格、运输费用、安装调试费用等。
其他损失：
- 如因机器损坏导致的停产经济损失、违约金、生产线闲置费用等也应纳入考虑范围。
三、赔偿原则与流程
赔偿原则：
- 赔偿责任应遵循公平、合理的原则，根据损失发生时的市场价格或其他合理方式计算赔偿金额。
- 赔偿责任可能通过扣除工资、支付赔偿金等方式实现，但需确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。
赔偿流程：
- 明确损坏原因：首先由单位或专业机构明确机器损坏的具体原因及员工有无过错。
- 评估损失：根据损失评估的结果确定赔偿金额。
- 协商赔偿：单位与员工就赔偿金额和方式进行协商，达成一致后可签订赔偿协议。
- 法律途径：如果协商不成，单位可以通过劳动仲裁或民事诉讼等法律途径解决争议。
法律依据：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按约定要求其赔偿，但每月扣除的工资部分不得超过当月工资的20%，且不得低于当地最低工资标准。
四、注意事项
保留证据：在整个过程中，单位应妥善保留相关证据，如照片、视频、维修发票、操作记录等，以保障自身的合法权益。
加强管理与培训：单位应加强设备管理，定期对员工进行培训和安全教育，提高员工对设备操作的熟练度和安全意识，以减少类似事件的发生。
综上所述，处理员工把机器操作坏了的赔偿问题时，需要明确责任归属，准确评估损失，遵循赔偿原则与流程，并严格依据相关法律法规进行。同时，单位也应加强自身管理，提高员工的安全意识和操作技能，以预防类似事件的发生。