在摩托车与电动车发生碰撞，且摩托车承担次要责任的情况下，赔付问题主要涉及以下几个方面：

一、赔付责任确定

首先，需要明确的是，赔付责任是根据事故责任比例来确定的。既然摩托车承担次要责任，那么其赔付比例通常会低于主要责任方。具体比例可能因地区、保险条款及事故具体情况而有所不同，但一般会在事故认定书中明确。

二、赔付项目

摩托车次责方需要赔付的项目主要包括：

1. 医疗费：根据电动车方受伤人员的实际医疗费用进行赔付，包括住院费、手术费、药品费等。
2. 护理费：如果电动车方有人员需要护理，那么护理费也是赔付项目之一，根据护理人员的收入或实际发生的护理费用计算。
3. 交通费：电动车方因就医或转院治疗实际发生的交通费用，也应由摩托车次责方按比例赔付。
4. 误工费：如果电动车方有人员因事故导致误工，那么其误工减少的收入也应得到赔付，具体根据误工时间和收入状况确定。
5. 其他损失：如电动车损坏修复费用、残疾赔偿金（如构成残疾）、精神损害抚慰金（如适用）等。

三、赔付流程

1. 事故认定：首先，需要等待交警部门出具事故认定书，明确事故责任比例。
2. 保险理赔：如果摩托车方购买了交强险和商业险，那么可以向保险公司申请理赔。保险公司会根据保险条款和事故责任比例进行赔付。
3. 协商或诉讼：如果保险理赔无法覆盖全部损失，或者双方对赔付金额有争议，那么可以通过协商或诉讼的方式来解决。

四、注意事项

1. 保留证据：事故发生后，应尽快收集并保留相关证据，如事故现场照片、医疗记录、费用发票等，以便后续赔付时使用。
2. 及时报案：事故发生后，应及时向交警部门和保险公司报案，以便他们能够及时介入处理。
3. 咨询专业意见：在处理赔付问题时，如果遇到复杂情况或争议，可以咨询专业律师或法律机构，以获取更准确的法律意见和帮助。

综上所述，摩托车碰电动车且摩托车承担次要责任时，赔付问题需要根据事故责任比例、赔付项目和赔付流程来确定。在处理过程中，应保留好相关证据，及时报案，并咨询专业意见以确保自己的权益得到妥善维护。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。