收费公路通行费电子票据汇总单本身并不是用于抵扣的凭证，而是作为已开具通行费电子票据的汇总信息证明材料。能否用于增值税进项税额抵扣，主要取决于具体的通行费电子发票类型。

根据相关规定，通行费电子发票包括两种类型：一种是左上角标识“通行费”字样且税率栏次显示适用税率或征收率的通行费电子发票（征税发票），另一种是左上角无“通行费”字样且税率栏次显示“不征税”的通行费电子发票（不征税发票）。

• 如果您通行经营性收费公路，由经营管理者开具的征税发票，是可以按规定用于增值税进项抵扣的。
• 如果您采取充值方式预存通行费，由ETC客户服务机构开具的不征税发票，则不可用于增值税进项抵扣。

因此，要判断您的收费公路通行费电子票据是否能用于抵扣，需要查看具体的电子发票类型。如果是征税发票，且符合抵扣条件，那么您可以在纳税申报时将其进项税额填写在《增值税纳税申报表附列资料(二)》的相应栏次中。

总的来说，收费公路通行费电子票据汇总单本身不直接用于抵扣，但可以作为已开具电子票据的汇总证明，方便您进行财务管理和会计核算。具体的抵扣情况还需根据电子发票的类型和相关规定来确定。