当摩托车被小车撞了，且摩托车驾驶人负主要责任时，赔偿问题需遵循一系列原则和流程。以下是对此情况的详细解答：
一、责任划分
首先，根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第九十一条，公安机关交通管理部门会根据交通事故当事人的行为对发生交通事故所起的作用以及过错的严重程度，来确定当事人的责任。摩托车主责意味着摩托车驾驶人在事故中的过错行为对事故发生起了主要作用。
二、赔偿责任
基本赔偿项目：
- 摩托车驾驶人需承担因其过错行为造成的人身损害和财产损失的赔偿。
- 这包括但不限于医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费，以及车辆维修费等。
伤残赔偿：
- 若因事故导致伤残，还需支付残疾赔偿金、残疾辅助器具费、被扶养人生活费，以及因康复护理、继续治疗而产生的康复费、护理费、后续治疗费。
死亡赔偿：
- 若不幸导致死亡，除了上述基本费用外，还需支付丧葬费、死亡赔偿金以及为办理丧事所花费的交通费、住宿费和误工损失等其他合理费用。
精神损害赔偿：
- 对于受害者或其家属的精神损害，也应提供相应的慰抚金。
三、保险赔偿
- 如果摩托车和小车都购买了交通事故责任强制保险（交强险），那么首先由保险公司在交强险责任限额范围内予以赔偿。
- 超过责任限额的部分，再由摩托车驾驶人按照其过错比例承担。
四、双方过错的处理
- 如果小车驾驶人也有过错，根据《中华人民共和国道路交通安全法》第七十六条，摩托车驾驶人只需按照其过错比例承担相应的赔偿责任。
- 即，双方都有过错的，按照各自过错的比例分担责任。
五、无力赔偿的处理
- 若摩托车驾驶人无力赔偿，受害人或其家属可以向法院提起诉讼，申请强制执行程序。
- 法院将根据实际情况，对摩托车驾驶人的财产进行查封、冻结或拍卖等措施，以用于赔偿受害人的损失。
综上所述，摩托车被小车撞了且摩托车驾驶人负主要责任时，赔偿问题需根据责任划分、赔偿责任、保险赔偿以及双方过错的比例来综合处理。若摩托车驾驶人无力赔偿，可通过法律途径解决。