有手续的宅基地上建房，一般不算违建。但具体是否构成违建，还需根据多种情况综合判断。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法手续的重要性：

   • 拥有合法的宅基地使用权证和建房相关手续（如建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等）是确保房屋合法性的关键。
   • 这些手续证明了建房行为已经经过了相关部门的审批，符合土地利用规划和建设要求。

2. 不构成违建的情况：

   • 若建房行为完全符合当时的政策、规划及申请条件，且已经取得了所有必要的手续，那么所建房屋就不属于违建。
   • 即使由于历史遗留原因，部分手续可能不全，但只要建房行为符合当时的宅基地使用规定，且不存在其他违法行为，通常也不应被简单认定为违建。

3. 可能构成违建的情况：

   • 若建房时未取得合法手续，或手续不齐全，且房屋建设不符合宅基地申请条件、土地利用规划或相关建设标准，那么所建房屋就可能被视为违建。
   • 例如，非本集体经济组织成员在该集体宅基地上建房，或房屋超出规划确定的宅基地范围，都可能构成违建。

4. 建议与指导：

   • 在宅基地上建房前，务必咨询当地相关部门，了解清楚需办理的手续和许可，确保建设行为合法。
   • 如已建房但不确定其合法性，应尽快补办相关手续或咨询专业人士以解决问题，避免可能的法律风险和经济损失。

综上所述，有手续的宅基地上建房一般不算违建，但具体还需根据建房时的政策、规划、申请条件及手续是否齐全等多种情况综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。