您好，关于您提出的“抵押物价值小于担保的债权时，抵押登记债权如何设定”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，抵押物价值确实可以低于担保的主债权数额，但这需要得到债权人的明确同意。在法律层面，《民法典》及《中华人民共和国担保法》均有相关规定，指出在债权人同意的情况下，抵押财产的价值可以低于担保的主债权数额。
在实际操作中，当抵押物的价值低于担保的主债权时，债权人应充分考虑以下几点：
风险评估：债权人需要对债务人的还款能力、信用状况以及抵押物的实际和潜在价值进行全面评估。由于抵押物价值可能受市场波动等因素影响而下降，因此债权人应谨慎评估相关风险。
明确约定：在设定抵押权时，债权人与债务人应明确约定抵押物的价值、评估方式、价值变动处理机制以及追偿方式等。这些约定应详细、明确，以确保双方权益得到妥善保护。
追偿机制：当债务人无法履行债务且抵押物处置变现后不足以清偿主债权时，债权人依法有权就剩余部分向债务人继续追偿。这一机制确保了债权人在抵押物价值不足时的权益保障。
在抵押登记方面，当抵押物价值低于担保的主债权时，登记机构通常会要求提供相关的债权债务合同、抵押合同以及债权人的同意书等文件。这些文件应明确载明抵押物的价值、担保的债权数额以及债权人的同意等内容。
总结来说，当抵押物价值低于担保的主债权时，只要得到债权人的明确同意，并采取相应的风险评估和追偿机制，就可以进行抵押登记并设定相应的债权。在此过程中，债权人和债务人应充分沟通、明确约定相关事项，以确保双方权益得到最大程度的保障。