门市土地使用证到期后，处理方式主要依据土地使用权的类型以及相关法律法规。以下是针对您问题的详细解答：

一、非住宅建设用地（如商业用地）使用权到期处理

1. 申请续期：

   • 根据《民法典》等相关法律规定，非住宅建设用地使用权期限届满后，土地使用者需在期满前一年（或按照当地政策规定的时间）向当地土地管理部门提出续期申请。
   • 提交续期申请时，需准备相关材料，如土地使用证、身份证明、续期申请书等。

2. 审批与重新签订合同：

   • 土地管理部门将对续期申请进行审查，主要考察是否符合城市规划、土地利用政策等要求。
   • 经审查批准后，土地使用者需与土地管理部门重新签订土地使用权出让合同，明确新的使用期限、出让金等条款。

3. 缴纳出让金：

   • 根据新签订的土地使用权出让合同，土地使用者需按规定缴纳相应的土地使用权出让金。
   • 出让金的具体金额和缴纳方式应依据当地政策和规定确定。

4. 办理登记：

   • 完成出让金缴纳后，土地使用者需前往土地管理部门办理土地使用权变更登记手续，领取新的土地使用证。

二、注意事项与建议

1. 及时了解政策：

   • 门市所有者应及时关注当地政府部门发布的相关通知和规定，确保按照法定程序办理续期手续。
   • 政策可能因地区而异，因此需特别关注当地的具体要求。

2. 保管好相关凭证：

   • 妥善保管土地使用权证书、合同、续期申请书等相关凭证，以便在需要时提供证明。

3. 寻求专业帮助：

   • 如遇纠纷或争议，建议咨询专业律师或相关机构，以获取专业的法律意见和帮助。

4. 考虑公共利益：

   • 在申请续期时，需考虑到公共利益的需要。若国家因公共利益需要收回土地使用权，将按照土地使用者使用土地的实际年限和开发土地的实际情况给予相应补偿。

综上所述，门市土地使用证到期后，应根据实际情况和法律规定选择合适的处理方式。及时关注政策动态、保管好相关凭证、寻求专业帮助以及考虑公共利益等因素，都是保障自身权益的关键。