您好，关于通行费电子发票为何不能抵扣的问题，这主要取决于发票的具体类型以及您支付通行费的方式。

首先，通行费电子发票分为两种类型：

1. 征税发票：这种发票的左上角会标识有“通行费”字样，并且税率栏次会显示适用的税率或征收率。当您通行经营性收费公路时，由经营管理者开具的就是这种征税发票。根据规定，这种发票是可以用于增值税进项抵扣的。
2. 不征税发票：与征税发票不同，这种发票的左上角没有“通行费”字样，且税率栏次会显示“不征税”。如果您采取充值方式预存通行费，那么由ETC客户服务机构开具的就是这种不征税发票。根据规定，这种发票是不能用于增值税进项抵扣的。

因此，如果您收到的通行费电子发票是不能抵扣的，那么很可能是因为它是一张不征税发票。这通常发生在您通过充值方式预存通行费的情况下。

另外，如果您对收到的发票类型或抵扣规定仍有疑问，建议您联系当地的税务部门或咨询专业的税务顾问，以获取更准确和具体的解答。希望这些信息能对您有所帮助！