车在车库被水淹了，保险公司是否会赔偿，这主要取决于您购买的保险险种、具体的保险条款以及车辆被淹时的具体情况。以下是对此问题的详细解答：
一、保险险种与赔偿
车损险：
- 自2020年9月19日车险综合改革后，车损险的覆盖范围已经包含了暴雨、洪水等自然灾害导致的车辆损失。因此，如果您购买了车损险，并且车辆被淹是由于自然灾害（如暴雨、洪水）导致的，那么保险公司通常会对车辆被淹的损失进行理赔。
- 理赔内容可能包括车辆的维修费用，如发动机、电子设备等部件的修复费用，以及施救费用、清洗费用等。
涉水险（附加险）：
- 涉水险是专门针对车辆因涉水行驶或被水淹后导致的发动机损坏进行赔偿的险种。
- 如果您购买了涉水险，那么即使车辆在水中熄火后又二次启动导致发动机损坏，只要符合涉水险条款规定，保险公司也会进行赔偿。
- 需要注意的是，涉水险通常有一定的绝对免赔率，如15%-20%，即保险公司会扣除一定比例后进行赔付。
交强险：
- 交强险主要是用于赔偿交通事故中第三方的人身伤亡和财产损失，不覆盖车辆自身被淹的损失。
二、理赔流程
- 及时报案：车辆被淹后，您应尽快联系保险公司报案，说明事故时间、地点及损失情况。
- 提供证据：根据保险公司的要求，您需要提供相关证明材料，如现场照片、维修发票、物业或社区出具的《车库被淹证明》等。这些证据将作为后续理赔的依据。
- 定损与赔付：保险公司会安排定损员对车辆进行定损，并根据定损结果和保险条款进行赔付。如果符合赔付条件，保险公司将在约定时间内完成审批，并通过短信或邮件通知您结果。
三、注意事项
- 避免二次损伤：在车辆被淹后，切勿强行启动浸水车辆，以防止发动机进一步损坏。同时，及时断开电池负极，减少电路短路的风险。
- 仔细阅读保险条款：不同的保险公司和保险产品，其保险条款可能有所不同。因此，在购买保险时，您应仔细阅读保险条款，了解具体的保险责任和免责条款。
- 时效限制：通常，您需要在事故发生之日起规定时间内（如48小时）报案。逾期报案可能会影响理赔的进程。
综上所述，如果车辆在车库被水淹了，并且您购买了相应的保险险种（如车损险、涉水险等），那么您有权向保险公司申请理赔。在申请理赔时，请务必遵循保险公司的理赔流程和注意事项，以确保顺利获得赔偿。