当您发现身份证丢失后被他人冒名注册了公司，这确实是一个严重的法律问题，需要您立即并采取一系列措施来维护自己的合法权益。以下是我为您提供的详细处理建议：
一、立即报案与证据收集
向公安机关报案：
- 携带您的有效身份证件（如补办的新身份证）到户籍所在地或公司注册地的公安机关报案。
- 详细说明身份证丢失的时间、地点以及被冒用注册公司的情况。
- 报案后将获得正式的报警记录，这是后续处理的重要证据。
收集身份证明与丢失证据：
- 搜集能证明您身份证曾丢失的材料，如补办身份证时的派出所受理回执、挂失证明等。
- 这些材料可以证明在公司注册的时间节点，您的身份证处于失控状态。
准备笔迹鉴定样本和不在场证明：
- 准备您平时的签名样本和书写文件，以便在必要时通过笔迹鉴定来支持您的主张。
- 如果可能，提供注册时您不在场的证明，如行程记录、工作证明或证人证言。
二、向市场监督管理部门反映情况
提交投诉举报：
- 携带您的身份证件、报警记录及其他相关证据，前往该公司注册地的市场监督管理部门。
- 填写投诉举报表格，详细说明身份证被冒用注册公司的情况。
- 要求市场监督管理部门撤销或变更基于错误身份信息的公司注册登记。
配合调查：
- 市场监督管理部门接到投诉后会进行调查核实。
- 在此期间，您应积极配合调查工作，按照要求提供相关信息和证据。
- 如实陈述事情经过，协助市场监督管理部门查明真相。
三、法律途径与专业咨询
申请撤销登记：
- 如果市场监督管理部门调查确认公司注册是冒用您的身份信息进行的，他们将依法撤销该公司的注册登记。
- 如果申请撤销不成功，您可以向法院提起行政诉讼，要求撤销作为法定代表人的变更登记。
民事诉讼：
- 您还可以选择向法院起诉公司或公司股东，确认您不存在股东身份或未接受委托成为法定代表人。
- 同时，可以起诉经办人侵犯您的姓名权，并要求公司涤除您的法定代表人或股东身份。
寻求法律援助与专业咨询：
- 在处理过程中，如果您遇到困难或对法律程序不熟悉，应及时寻求法律援助或咨询专业律师的意见。
- 律师可以帮助您评估案件的严重性，提供具体的法律建议，并协助您准备必要的法律文件。
四、后续处理与个人信用修复
撤销注册登记后的后续处理：
- 一旦市场监督管理部门撤销了公司的注册登记，您应及时向相关金融机构、信用评级机构等说明情况。
- 要求消除因该冒用行为导致的不良信用记录。
加强个人信息保护：
- 为防止类似事件再次发生，您应加强个人身份信息的保护。
- 定期更换密码、使用安全的网络环境、不轻易透露个人信息等。
- 及时在相关机构进行身份证挂失和补办手续，确保身份信息得到及时更新和保护。
总之，处理这类问题需要耐心和时间，但只要您坚持维权并积极采取措施，最终定能得到妥善的处理结果。希望这些建议能对您有所帮助。