公安机关将肇事肇祸严重精神障碍患者纳库管理的法律依据主要来自于《中华人民共和国精神卫生法》、《中华人民共和国刑法》以及《中华人民共和国治安管理处罚法》等相关法律法规。以下是对这些法律依据的详细阐述：
《中华人民共和国精神卫生法》：
- 该法第三十五条明确规定，当疑似精神障碍患者发生伤害自身、危害他人安全的行为，或者有伤害自身、危害他人安全的危险情形时，其监护人、近亲属应当立即将其送往医疗机构进行精神障碍诊断。医疗机构应当立即实施住院治疗，并在实施住院治疗时告知患者及其监护人治疗方案和可能的风险。
- 第四十条则授权医疗机构在精神障碍患者已经发生伤害自身、危害他人安全的行为，或者有伤害自身、危害他人安全的危险情形时，可以对患者实施住院治疗，监护人应当同意。监护人不同意的，医疗机构不得对患者实施住院治疗。监护人应当对在家居住的患者做好看护管理。
《中华人民共和国刑法》：
- 第十八条详细规定了精神病人在不能辨认或者不能控制自己行为的时候造成危害结果，经法定程序鉴定确认的，不负刑事责任，但是应当责令他的家属或者监护人严加看管和医疗；在必要的时候，由政府强制医疗。这一条款为公安机关对肇事肇祸严重精神障碍患者的管理提供了法律基础。
《中华人民共和国治安管理处罚法》：
- 第十三条规定，精神病人在不能辨认或者不能控制自己行为的时候违反治安管理的，不予处罚，但是应当责令其监护人严加看管和治疗。间歇性的精神病人在精神正常的时候违反治安管理的，应当给予处罚。这一条款为公安机关在处理肇事肇祸严重精神障碍患者时提供了具体的法律指导。
此外，相关政策文件与地方规范性文件也对肇事肇祸严重精神障碍患者的列管与管控工作提出了具体要求。例如，《关于加强肇事肇祸等严重精神障碍患者救治救助工作的意见》要求全面落实救治救助政策措施，多部门协作配合，建立综合管理机制。地方规范性文件则进一步细化了肇事肇祸精神病人的排查、登记、评估、管控等工作流程和责任分工。
综上所述，公安机关将肇事肇祸严重精神障碍患者纳库管理，是严格遵循相关法律法规和政策文件的要求，旨在有效减少精神障碍患者肇事肇祸事件的发生，保障社会秩序和公共安全。同时，这一管理也需要医疗机构、社区及家属等多方的协作与配合，共同建立综合管理机制。