灵活就业人员社保缴费确实包含医保。以上海市为例，根据上海市人力资源和社会保障局、上海市医疗保障局以及国家税务总局上海市税务局联合发布的《关于灵活就业人员参加本市职工基本养老、职工基本医疗保险有关问题的通知》，灵活就业人员可以参加职工基本养老保险和职工基本医疗保险。这意味着，灵活就业人员在缴纳社保费用时，需要同时缴纳基本养老保险费和基本医疗保险费。

具体来说，灵活就业人员缴纳基本养老、医疗保险费的基数在本市上年度全口径城镇单位就业人员月平均工资的60%至300%之间，由本人自行选择。其中，缴纳职工基本养老保险费的比例为24%，缴纳职工基本医疗保险费的比例为11%。在参保缴费后，社会保险经办机构会为其建立基本养老、医疗保险个人账户，并按照国家和本市规定记账并计算缴费年限。

因此，对于灵活就业人员来说，他们的社保缴费中是包含医保的，这也保障了他们在医疗方面的权益。需要注意的是，不同地区的具体政策可能会有所不同，但大体上都会包含医保这一重要部分。如果灵活就业人员有任何疑问或需要更详细的信息，建议咨询当地的人社部门或医保部门。