针对您提出的“楼上装修打穿楼下楼顶去哪部门投诉”的问题，您可以首先尝试与楼上邻居进行友好协商，如果协商无果，可以向以下几个部门或机构进行投诉：

1. 小区物业管理部门：

   • 根据《住宅室内装饰装修管理办法》的相关规定，装修人或装修企业与物业管理单位应签订住宅室内装饰装修管理服务协议。因此，物业管理部门有责任对装修活动进行管理和协调。您可以向物业反映楼上装修导致楼下楼顶被打穿的情况，要求物业介入协调并寻求解决方案。

2. 社区居委会：

   • 如果物业管理部门无法解决问题或者您对物业的处理结果不满意，您可以向所在社区的居委会进行投诉。居委会作为基层群众自治组织，有义务协助解决居民之间的纠纷。

3. 住房城乡建设部门：

   • 如果问题依然无法得到解决，且涉及房屋结构安全等严重问题，您可以向当地的住房城乡建设部门（如房管局、建委等）进行投诉。这些部门有责任对房屋装修活动进行监管，并确保房屋结构安全。

在投诉过程中，建议您保留好相关证据，如照片、视频、装修合同等，以便在需要时提供证明。同时，保持冷静和理性，避免与楼上邻居发生不必要的争执。

希望这些建议能对您有所帮助。如果您在投诉过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。