企业统计年报主要由国家统计局及其下属的各级统计局负责。具体规定如下：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国统计法》的相关规定，国家统计局负责制定国家统计调查制度，并组织实施。企业（单位）研发活动统计报表制度作为国家统计调查制度的一部分，由国家统计局统一要求，各省、自治区、直辖市统计局按照规定的统计范围、统计口径和计算方法进行组织实施。

2. 负责部门：

   • 国家统计局对全国范围内的企业研发活动及相关情况进行全面或抽样调查，包括重点企业、规模以上企业以及特定行业的企业等。
   • 各省、自治区、直辖市统计局负责本地区内的企业统计年报工作，按照国家统计局的要求报送基层数据，并确保数据的真实、准确、完整和及时。

3. 报表制度与执行：

   • 企业统计年报制度是国家统计调查制度的重要组成部分，旨在摸清全国研发活动的基本情况，为各级政府制定政策和计划、进行管理与调控提供依据。
   • 报表制度中明确了调查表式、指标解释、统计范围、报送日期及方式等具体内容，确保统计工作的规范性和统一性。

综上所述，企业统计年报主要由国家统计局及其下属的各级统计局负责，它们按照《中华人民共和国统计法》和相关统计调查制度的规定，组织实施企业统计年报工作，并确保数据的真实性和准确性。如有任何关于企业统计年报的具体问题或疑问，可直接向我咨询。