农村合作医疗卡通常不会被法院冻结，但如果该卡的金融账户被激活并存有个人资金，且持卡人涉及经济纠纷等法律案件未履行债务，则该金融账户有可能被法院查询、冻结或划扣。以下是详细分析：

1. 农村合作医疗卡的性质与用途：

   • 农村合作医疗卡（现多称为城乡居民医保卡）是农村居民享受基本医疗保险待遇的重要工具。
   • 该卡主要用于参保人在就医时进行结算和报销医疗费用，并不具备储蓄账户的功能。
   • 基于其特殊性质和用途，农村合作医疗卡在一般情况下不会成为法院冻结的对象。

2. 金融账户激活后的特殊情况：

   • 如果参保人将农村合作医疗卡中的金融账户激活，该账户便具备了与普通银行借记卡相同的功能，可以存有个人的资金。
   • 在这种情况下，若持卡人因涉及经济纠纷或其他法律案件，被法院判决需要履行债务而未履行，法院则有权依法对该社保卡的金融账户采取查询、冻结和划扣等执行措施。

3. 法律原则与依据：

   • 法院通常会根据法律程序和相关规定，对涉及债务纠纷、法律判决等案件的当事人进行财产的查封、扣押或冻结，以保障债权人的权益并确保法律判决能够得到执行。
   • 但农村合作医疗卡内的资金并非一般意义上的个人财产，而是具有明确专用性和社会保障性质的专项资金，因此受到特定法律和政策的保护。

综上所述，农村合作医疗卡因其特殊的性质和用途，在一般情况下不会被法院冻结。然而，如果持卡人激活了该卡的金融账户并存有个人资金，且涉及法律纠纷未履行债务，则该金融账户可能会受到法院的执行措施。因此，持卡人在使用农村合作医疗卡时，应遵守相关法律法规，避免涉及法律纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。