电动车闯红灯是否会扣机动车的分，主要取决于电动车的类型。

首先，我们需要明确电动车的分类。电动车主要分为非机动车（如电动自行车）和机动车（如电动摩托车、电动轻便摩托车）两大类。这两类电动车在闯红灯时的法律后果是不同的。

对于非机动车（如电动自行车）来说，由于其设计时速、整车质量等因素，被归类为非机动车。因此，当这类电动车闯红灯时，不会扣除机动车驾驶证的分数。但是，这并不意味着闯红灯没有后果。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，非机动车闯红灯违反了道路交通安全法规，将面临警告或五元以上五十元以下的罚款。如果驾驶人拒绝接受罚款，执法部门还有权扣留其非机动车。

而对于机动车（如电动摩托车、电动轻便摩托车）来说，由于其设计时速、整车质量、电动机功率等达到机动车标准，因此需持相应驾驶证（D、E、F证）驾驶。当这类电动车闯红灯时，就属于机动车违法行为。依据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，将一次扣6分，并处以200元罚款。

因此，电动车闯红灯是否会扣机动车的分，关键要看电动车的类型。为了避免不必要的麻烦和损失，建议电动车驾驶人严格遵守交通规则，不闯红灯，确保自身及他人的道路安全。同时，也建议驾驶人准确了解所骑电动车的性质，以便更好地了解自己的权利和义务。