灵活就业人员入职后，社保的交纳方式会有所变化。在入职之前，灵活就业人员通常是以个人身份参加企业职工基本养老保险或城乡居民基本养老保险，缴费由个人承担。然而，一旦入职成为公司的正式员工，社保的交纳就将由公司和个人共同承担，具体流程如下：

首先，公司的人力资源部门会为员工办理社保入职手续，这通常包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等五险一金的交纳。员工需要提供相关的个人身份信息、银行卡信息等，以便公司能够准确地将社保费用交纳到相应的社保账户中。

在交纳比例上，公司和个人会按照当地社保政策规定的比例进行分担。一般来说，公司承担的比例会高于个人承担的比例。具体比例因地区和政策而异，员工可以咨询公司的人力资源部门或当地社保机构以获取准确的信息。

在交纳方式上，公司通常会通过银行代扣的方式将社保费用从员工的工资中扣除，并统一交纳到社保机构。员工只需要确保自己的工资账户中有足够的余额用于扣除社保费用即可。

此外，对于之前以灵活就业人员身份参加社保的员工，入职后需要将个人社保账户转移到公司社保账户下。这通常涉及到社保关系的转移和接续，员工需要携带相关证件和资料到当地社保机构办理转移手续。具体流程和要求可能因地区而异，建议员工提前咨询当地社保机构或公司的人力资源部门以获取详细的指导。

总之，灵活就业人员入职后，社保的交纳方式将由个人承担转变为公司和个人共同承担。员工需要了解当地的社保政策和规定，并配合公司的人力资源部门完成社保入职手续和交纳工作。如有任何疑问或问题，可以及时咨询当地社保机构或公司的人力资源部门以获取帮助和解答。