申请高新技术企业并不需要直接提交员工的学历证书，但员工的学历和教育背景在高新技术企业认定过程中是一个重要的考量因素，主要体现在以下几个方面：

首先，高新技术企业认定条件中明确规定了科技人员占企业当年职工总数的比例应不低于10%。在证明企业科技人员比例时，虽然学历证书不是唯一的标准，但它是评估员工是否具备科技研发能力的一个重要参考。科技人员的定义中包括了直接从事研发和相关技术创新活动的人员，这些人员通常需要具备一定的专业知识和教育背景，而学历证书是证明其教育背景的一种重要方式。

其次，虽然申请高新技术企业时不需要直接提交员工的学历证书，但在企业申报材料中，需要包含科技人员的劳动合同、社保缴纳记录等相关证明材料。这些材料可以间接反映员工的学历和教育背景，因为学历通常是影响员工职业发展和薪资水平的重要因素，也是企业招聘和选拔科技人员时考虑的关键因素之一。

此外，高新技术企业认定过程中还会对企业的研发组织管理水平进行评估，其中包括企业是否具备健全的人力资源管理体系、是否对人力资源进行了专业化、系统化的规划等。这些评估内容也会涉及到员工的学历和教育背景，因为高学历、高素质的员工队伍通常意味着企业具备更强的研发能力和创新能力。

综上所述，虽然申请高新技术企业时不需要直接提交员工的学历证书，但员工的学历和教育背景在高新技术企业认定过程中仍然是一个重要的考量因素。因此，企业在准备申报材料时，应该注重展示员工的学历和教育背景，以及企业在人力资源方面的优势和特色。