关于“证人不配合公安机关调查怎么处理”的问题，我可以给你以下的解答：

首先，明确一点：证人有义务配合公安机关的调查。根据相关法律规定，凡是知道案件情况的人，都有作证的义务。如果证人拒绝配合公安机关的调查，那么公安机关及司法机关有权采取一系列措施来确保司法程序的顺利进行。

1. 强制到庭：若证人经公安机关或人民法院通知后，无正当理由拒绝作证，人民法院有权强制其到庭。这是法律对证人作证义务的严肃体现，旨在确保案件能够得到公正审理。
2. 训诫与拘留：对于无正当理由拒绝出庭或出庭后拒绝作证的证人，法院将予以训诫。若情节严重，经院长批准，还可处以十日以下的拘留。这种惩罚性措施是为了维护司法权威，防止证人逃避作证责任。
3. 特殊情况的考虑：若证人存在无法出庭作证的合理情形，如庭审期间身患严重疾病、居所远离开庭地点且交通极为不便等，人民法院可准许其不出庭，但应要求其提供书面证言或其他形式的证据。

此外，需要强调的是，证人应当如实陈述证言。如果故意提供虚假证词或者隐瞒犯罪证据，将承担相应的法律责任。

综上所述，证人不配合公安机关调查时，公安机关及司法机关有权采取多种措施来确保其履行作证义务。这些措施既包括了强制到庭、训诫与拘留等惩罚性手段，也考虑了特殊情况下的灵活处理。如果你或你身边的人遇到了类似的情况，建议及时咨询专业律师，以便更好地了解相关法律规定并妥善处理。