股东以土地使用权作为出资，确实涉及多种税种的缴纳。以下是对这一过程中可能涉及的税种进行的详细分析：

1. 增值税：

   • 政策依据：根据《财政部 国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》，股东以土地使用权出资取得股权，这一行为被视为增值税应税行为。
   • 税率：根据土地使用权取得的时间不同，税率也有所区别。一般纳税人转让2016年4月30日前取得的土地使用权，可选择简易计税方法，税率为5%；转让2016年5月1日后取得的土地使用权，则适用一般计税方法，税率为9%。对于小规模纳税人，转让土地使用权的税率为3%，但在2023年1月1日至2023年12月31日期间，减按1%征收率征收。

2. 土地增值税：

   • 政策依据：根据《中华人民共和国土地增值税暂行条例》及其实施细则，股东以土地使用权出资实质是土地使用权的转让行为。但需注意，根据《财政部 税务总局关于继续实施企业改制重组有关土地增值税政策的公告》，在改制重组时以房地产作价入股进行投资，暂不征土地增值税，但这一政策不适用于房地产开发企业。
   • 税率：若需缴纳，土地增值税实行四级超率累进税率，从30%至60%不等。

3. 企业所得税（适用于股东为企业时）：

   • 政策依据：根据《中华人民共和国企业所得税法》及其实施条例，企业以非货币性资产对外投资应视同销售货物、转让财产，确认资产转让所得并缴纳企业所得税。
   • 税率：一般为25%，但小型微利企业可减按20%缴纳，高新技术企业则可减按15%缴纳。

4. 个人所得税（适用于股东为个人时）：

   • 政策依据：根据《财政部 国家税务总局关于个人非货币性资产投资有关个人所得税政策的通知》，个人以非货币性资产投资应计算缴纳个人所得税。
   • 税率：个人因财产转让所得应缴纳的比例税率为20%。同时，纳税人可合理确定分期缴纳计划并报主管税务机关备案。

5. 印花税：

   • 政策依据：根据《中华人民共和国印花税法》及《印花税暂行条例》，股东以土地使用权出资签订的投资协议属于产权转移书据，应缴纳印花税。
   • 税率：产权转移书据的印花税税率为所载金额的万分之五。

6. 契税：

   • 政策依据：承受国有土地使用权的行为通常需要缴纳契税。但根据相关规定，企业以土地使用权作价入股进行投资或联营，且所投企业或联营企业非从事房地产开发的，可免征契税。
   • 注意事项：具体的免税政策可能因地区和时间的不同而有所变化，建议在操作前咨询当地税务部门确认。

综上所述，股东以土地使用权出资时，应综合考虑上述各税种的缴纳情况，并根据具体情况进行税务筹划。由于税务政策可能随时间变化，建议在操作前咨询专业的税务顾问或律师，以确保合规并降低税务风险。