当您发现土地承包经营权证上的面积与实际面积不符时，可以按照以下步骤进行处理：

一、确认实际面积

首先，建议您通过专业的测量机构或当地土地管理部门进行实际面积的测量，以确保获取到准确的数据。这一步是后续处理的基础。

二、准备必要材料

在确认实际面积后，您需要准备以下材料以便进行更正申请：

1. 土地证原件：作为土地权属的证明。
2. 证明错误登记的证据性资料：包括实际测量的数据、测量报告等，以证明土地证上记载的面积确实存在错误。
3. 其他辅助性资料：可能包括土地承包合同、相关部门的证明文件等，用于辅助说明情况。

三、提交更正申请

带着准备好的材料，您需要前往土地证登记机关（通常是当地土地管理部门或乡（镇）人民政府农村经营管理部门）提交更正登记申请。在申请时，请详细说明情况，并附上所有相关证据和资料。

四、等待审核与处理

土地证登记机关在收到您的申请后，会进行审核。如果审核通过，他们会报请原发证机关办理换发、补发手续，或者直接在原土地证上进行更正。这一过程可能需要一定的时间，请您耐心等待。

五、注意事项

1. 及时申请：发现面积不符后，应尽快申请更正，以避免可能的权益纠纷。
2. 保持沟通：在申请过程中，与土地管理部门保持密切沟通，了解申请进度和可能遇到的问题。
3. 法律咨询：如果遇到复杂或难以解决的问题，可以考虑寻求专业法律人士的帮助，以确保您的权益得到充分保护。

综上所述，当您发现土地承包经营权证上的面积与实际面积不符时，不必过于担心。通过按照上述步骤进行申请和更正，您可以有效解决问题并保障自己的合法权益。