在探讨三级医院和三甲医院住院报销比例是否有区别之前，我们首先要明确这两个概念在医疗体系中的定位。一般来说，三级医院通常指的是医院的等级，它代表了医院的规模、设施、技术水平和医疗服务能力等方面的高标准。而三甲医院，则是根据中国的医院评审制度，对医院进行的等级评定中的一种，表示该医院在医疗质量、教学、科研等多方面都达到了较高的水平。

然而，在实际的医疗体系和医保报销政策中，我们并没有直接将“三级医院”和“三甲医院”作为报销比例的划分标准。报销比例通常与医疗机构的级别（如一级、二级、三级）以及参保人的医保类型（如职工医保、居民医保等）相关。

以深圳市为例，根据《深圳市医疗保障办法》，职工基本医保一档参保人在一级以下医院、二级医院、三级医院住院的报销比例分别为94%、92%、90%；而职工基本医保二档及居民基本医保参保人在这些级别医院的报销比例则略有不同。这种设置主要是为了引导患者合理分流，促进医疗资源的有效利用。

同样，其他地区的医保报销政策也可能存在类似的差异，但都会根据当地的实际情况进行制定。因此，要准确回答三级医院和三甲医院住院报销比例是否有区别，我们需要具体参考当地的医保报销政策。

总的来说，三级医院和三甲医院的住院报销比例并非直接由这两个名词决定，而是受到多种因素的影响，包括医疗机构的级别、参保人的医保类型以及当地的医保报销政策等。因此，在了解具体的报销比例时，建议咨询当地的医保部门或相关机构以获取最准确的信息。