针对您提出的“不抵扣发票勾选后如何申报”的问题，以下是详细的解答步骤：

首先，需要明确的是，当您在增值税发票综合服务平台（企业版）中将某张发票勾选为“不抵扣”后，这张发票的数据将不会体现在您的申报表中。也就是说，勾选为“不抵扣”的发票不需要也不应该被包括在您提交的申报抵扣数据里。

接下来，关于具体的申报流程，您可以按照以下步骤进行：

1. 完成勾选操作：在增值税发票综合服务平台上，对需要抵扣的发票进行勾选，并特别注意将不需要抵扣的发票勾选为“不抵扣”。

2. 申请统计：在征期内，完成当期抵扣勾选后，您需要前往“抵扣勾选统计”模块进行申请统计。这一步骤将生成本期可用于申报抵扣的发票汇总统计表。请注意，此时勾选为“不抵扣”的发票不会包含在这个统计表中。

3. 确认签名：在申请统计后，您需要对生成的抵扣勾选统计表进行确认签名。这是申报抵扣前的必要步骤，也是确保数据准确性的关键环节。确认签名后，当前统计表将作为申报抵扣的依据。

4. 提交申报：完成确认签名后，您就可以按照正常的流程提交增值税申报表了。在提交申报时，请确保申报表中的数据与您在平台上确认签名的抵扣勾选统计表数据一致。

另外，有几点需要注意的事项：

• 如果您在非增值税申报期进行了“申请统计”操作，那么之后您仍然可以继续对发票进行抵扣/不抵扣操作，但此时不能进行确认签名。
• 如果在增值税申报期内进行了“申请统计”操作，那么之后必须撤销统计才能进行抵扣/不抵扣操作。
• “确认签名”功能仅在申报期内开放，且支持多次操作。如果您需要撤销签名以进行进一步的勾选操作，可以在申报期内进行。

综上所述，对于勾选为“不抵扣”的发票，您只需要在申报时确保它们不被包括在抵扣数据中即可，无需进行额外的操作或处理。希望这个解答能够帮助您顺利完成申报工作。