甲方对招标代理机构确实负有监督责任。以下是对此结论的详细阐述：
在建设工程领域，甲方作为招标人，与招标代理机构之间建立的是委托代理关系。根据这种关系，甲方将招标事宜委托给招标代理机构进行，但甲方并不因此完全免除其在招标过程中的责任和义务。相反，甲方仍需对招标代理机构的行为进行必要的监督和检查，以确保招标活动的合法、公正和透明。
具体来说，甲方的监督责任包括但不限于以下几个方面：
对招标文件的监督：甲方应审查招标代理机构编制的招标文件，确保其符合法律法规的要求，不含有歧视性条款或不合理要求，以保障所有潜在投标人的平等竞争机会。
对招标过程的监督：甲方应关注招标代理机构的招标公告发布、投标人资格预审、开标、评标等关键环节，确保这些环节符合法定程序，防止招标代理机构出现违法违规行为。
对招标结果的监督：甲方应对招标代理机构推荐的中标候选人进行复核，确认其符合招标文件和法律法规的要求，防止因招标代理机构的失误或不当行为导致中标结果的不公正。
综上所述，甲方在招标过程中对招标代理机构负有监督责任，这是保障招标活动合法、公正和透明的重要一环。如甲方在监督过程中发现招标代理机构存在违法违规行为，应及时采取措施予以纠正，并视情况向相关部门报告。