厂里员工在以下情况下可以申请退个人所得税：

1. 年度综合所得年收入额不足6万元：

   • 如果员工在一年内的工资、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等综合所得总收入低于6万元，但平时已经预缴了个人所得税，那么在年度汇算时，可以向税务机关申请退税。

2. 有符合享受条件的专项附加扣除未申报：

   • 员工在纳税年度内可能享有子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金、赡养老人以及3岁以下婴幼儿照护等专项附加扣除。如果这些扣除在预缴税款时没有申报，或者申报不全面，导致多交了税，那么在年度汇算时可以申请退税。

3. 因年中就业、退职或部分月份没有收入：

   • 如果员工在年中因为就业、退职或者某些月份没有收入，导致基本减除费用（即6万元的费用减除）、专项扣除（如“三险一金”）、专项附加扣除等扣除不充分，也可以在年度汇算时申请退税。

4. 仅取得劳务报酬、稿酬、特许权使用费所得：

   • 对于没有任职受雇单位，仅通过提供劳务、创作作品或转让特许权等方式取得收入的员工，他们可能需要在年度汇算时办理各种税前扣除，从而可能产生退税。

5. 劳务报酬、稿酬、特许权使用费预扣率高于全年综合所得税率：

   • 如果员工在年度中间取得的劳务报酬、稿酬、特许权使用费所适用的预扣率高于全年综合所得所适用的税率，那么在年度汇算时，通过重新计算应纳税额，可能会发现应缴纳的税金降低，从而获得退税。

6. 有符合条件的公益慈善事业捐赠支出未扣除：

   • 员工在纳税年度内进行的符合条件的公益慈善事业捐赠，如果捐赠额未超过纳税人申报的应纳税所得额30%的部分（或根据特定规定全额扣除），且预缴税款时未办理扣除，那么在年度汇算时也可以申请退税。

7. 年终奖税率问题：

   • 如果员工在年底取得的年终奖所适用的税率高于其综合所得税率，并且年终奖全额并入综合所得后不会提高综合所得税率级数，那么在个税汇算时选择将年终奖全年一次性奖金计税方式全部并入综合所得，也可能会发现应缴纳的税金降低，从而获得退税。

综上所述，员工在符合上述任一或多种情况下，都可以在年度个人所得税综合所得汇算时向税务机关申请退税。为了确保退税的准确性和顺利性，建议员工在申请退税前仔细核对自己的收入、扣除和预缴税款情况，并咨询专业的税务人员或机构以获取更详细的指导和帮助。