当您起诉被告而被告不配合时，可以采取以下措施来应对：

首先，您可以向法院申请强制令，要求被告配合诉讼程序，如提交证据、出庭等。法院会根据具体情况进行审查，如果确实有必要且符合法律规定，法院会作出相应的裁定，并督促被告予以配合。这一措施是法律赋予您的权利，旨在保障诉讼的正常进行。

其次，与承办案件的法官保持密切沟通也是至关重要的。您应该及时向法官反映被告不配合的情况，并提供相关线索和证据，以便法官能够更好地了解案件情况，并督促被告配合诉讼。法官在诉讼过程中起着重要的调解和监督作用，他们的协助将有助于推动诉讼的顺利进行。

此外，如果被告的不配合行为严重干扰了诉讼的正常开展，法院有权采取一系列司法处罚措施，如罚款、拘留等。这些措施旨在对被告的不配合行为进行制裁，并维护诉讼的公正性和权威性。因此，您不必担心被告的不配合行为会无限期地拖延诉讼进程。

最后，在整个诉讼过程中，您一定要妥善保存好与诉讼相关的所有材料和证据。这些材料和证据是支持您诉讼主张的重要依据，也是法院作出裁决的重要依据。如果因为疏忽或不当保管导致证据丢失或损坏，可能会对您的诉讼产生不利影响。

综上所述，面对被告不配合的情况，您应该积极采取措施应对，并借助法院的力量来维护自身的合法权益。通过申请强制令、与法官沟通、留存证据等方式，您可以有效地推动诉讼的顺利进行，并争取到应有的法律权益。