个体工商户被员工告时，为保障自己的权益，可以从以下几个方面着手：

1. 明确被诉原因与法律依据：

   • 首先，需详细了解员工提起诉讼的具体原因，比如是劳动争议（如工资、加班费、解除劳动合同等）、侵权纠纷还是其他法律争议。
   • 接着，根据员工提出的诉求，查找相关的法律法规，明确自身的法律义务与责任，以及员工所主张权利的法律依据。

2. 收集与整理证据：

   • 证据是诉讼中的关键。应全面收集与案件相关的证据材料，如劳动合同、工资支付记录、考勤记录、工作交接单、通讯记录等。
   • 特别注意保存电子证据，如电子邮件、短信、微信聊天记录等，这些在现代劳动争议中越来越重要。
   • 对收集到的证据进行分类、编号，并制作证据清单，以便在诉讼中清晰、有序地展示。

3. 寻求专业法律帮助：

   • 作为个体工商户，面对法律诉讼可能缺乏足够的专业知识和经验。因此，建议尽快咨询并委托专业律师代理诉讼。
   • 律师能够根据你的具体情况，提供针对性的法律建议，制定诉讼策略，并代表你出庭应诉，有效维护你的合法权益。

4. 积极应诉与协商：

   • 在收到法院传票或诉讼材料后，应在规定时间内向法院提交答辩状及相关证据，积极应诉。
   • 同时，也可以尝试与员工进行协商，寻求和解或调解的可能性。通过友好协商解决争议，往往能够节省时间和成本，避免长期的法律纠纷。

5. 遵守法律程序与判决：

   • 在诉讼过程中，应严格遵守法律程序，尊重法院的判决和裁定。
   • 如果法院判决对你有利，应依法执行判决；如果不服判决，可以在规定时间内提起上诉。

综上所述，个体工商户在面对员工诉讼时，应明确被诉原因与法律依据，积极收集证据，寻求专业法律帮助，并积极应诉与协商。同时，也要遵守法律程序与判决，以维护自己的合法权益。