针对“销售死因不明的动物的处罚，在防疫法和农产品质量安全法中均有罚则，应如何适用”的问题，以下是我的详细解答：

结论前置：销售死因不明的动物，同时违反了《中华人民共和国动物防疫法》和《中华人民共和国农产品质量安全法》的相关规定，但通常会依据具体案情和违法行为的性质，由相关部门选择适用更为直接或严厉的法条进行处罚。在实际执法中，农业农村部门往往依据《动物防疫法》进行处罚，因其对动物防疫有更为具体和明确的规定。

详细分析：

1. 法律条款适用：

   • 《中华人民共和国动物防疫法》第二十九条明确规定禁止屠宰、经营、运输死因不明的动物，并设定了相应的法律责任。
   • 《中华人民共和国农产品质量安全法》也对农产品的质量安全有相关规定，但针对死因不明动物的销售，其规定可能不如《动物防疫法》具体和直接。

2. 实际执法情况：

   • 在实际执法中，农业农村部门作为动物防疫的主管部门，通常会依据《动物防疫法》对销售死因不明动物的行为进行查处。
   • 处罚措施包括没收违法所得、罚款、以及禁止从事相关活动等，具体处罚力度会根据违法行为的严重程度和货值金额等因素确定。

3. 法律建议：

   • 对于畜牧从业者而言，应严格遵守相关法律法规，不得屠宰、经营、运输死因不明的动物。
   • 如遇类似情况，应及时向当地农业农村部门报告，并配合调查处理。
   • 如对处罚决定有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。

综上所述，销售死因不明的动物是违法行为，通常会依据《中华人民共和国动物防疫法》进行处罚。畜牧从业者应提高法律意识，遵守相关规定，确保动物及其产品的质量安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。