助理医师不可以在诊所执业为主要负责人或独立开办诊所。根据相关规定，开办诊所的医生需取得《医师资格证书》和《医师执业证书》，并连续从事同一专业临床工作满5年以上。而助理医师并不具备独立行医的资格，他们需要在执业医师的指导下，在医疗卫生机构中按照注册的执业类别、执业范围执业。只有在乡、民族乡、镇和村医疗卫生机构以及艰苦边远地区县级医疗卫生机构中执业的执业助理医师，根据医疗卫生服务情况和本人实践经验，才可能独立从事一般的执业活动。但这种情况并不适用于开办诊所或成为诊所的主要负责人。因此，如果您是助理医师，并希望在诊所执业，您需要进一步提升自己的资质，取得执业医师证后方可实现。