针对“检察院不予起诉的案件，公安机关怎么办”这一问题，以下是详细的解答：
当检察院作出不予起诉的决定时，公安机关需根据具体情况采取不同的措施。具体来说：
法定不起诉：若犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者存在《刑事诉讼法》规定的不应追究刑事责任的情形，公安机关在收到不起诉决定书后，应立即释放被采取强制措施的犯罪嫌疑人，或者撤销案件，并解除对财物的查封、扣押、冻结等措施。
酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者可以免除刑罚的，公安机关在收到不起诉决定书后，同样应立即释放被拘留的犯罪嫌疑人，或者变更强制措施。同时，若被不起诉人需要给予行政处罚、行政处分或者需要没收其违法所得的，公安机关应提出检察意见，移送有关主管机关处理。若公安机关认为不起诉决定有误，可在收到不起诉决定书后七日以内向作出决定的检察院申请复议，若复议意见未被采纳，还可向上一级检察院提请复核。
证据不足不起诉：若检察院因证据不足而作出不起诉决定，公安机关在后续若收集到新的证据，且符合起诉条件时，可以重新移送审查起诉。在此之前，公安机关应根据具体情况，对案件进行进一步调查或处理。
综上所述，公安机关在收到检察院的不起诉决定书后，应依据具体情况进行妥善处理，包括释放被采取强制措施的犯罪嫌疑人、撤销案件、解除对财物的查封等，以及根据需要对被不起诉人进行行政处罚等后续处理。同时，若公安机关认为不起诉决定有误，可依法申请复议或提请复核。