驾驶证扣分后，第二年不一定会清零。具体是否清零，与扣分的具体情况以及驾驶员是否在一个记分周期内有所记分有关。

首先，根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，道路交通安全违法行为累积记分周期（即记分周期）为12个月，满分为12分。从机动车驾驶证初次领取之日起计算。这意味着，驾驶证的记分周期是以初次领证日期为起点的12个月。

接下来，我们分情况讨论：

1. 如果在一个记分周期内记分未达到12分，并且罚款已缴纳：

   • 那么在一个记分周期结束后，记分会自动清零。例如，如果你的驾驶证在2023年1月1日初次领取，那么在2024年1月1日之前，如果你的记分未达到12分，并且相关罚款已经缴纳，那么记分会在2024年1月1日自动清零。

2. 如果在一个记分周期内记分达到或超过12分：

   • 那么你需要参加道路交通安全法律、法规和相关知识的学习，并通过考试来恢复驾驶证的正常使用。在这种情况下，记分不会自动清零，而是需要通过学习和考试来消除。

3. 如果记分是由于某些严重的交通违法行为导致的：

   • 比如酒驾、醉驾等，那么可能会面临更严重的处罚，包括吊销驾驶证等。在这种情况下，记分同样不会自动清零，而是需要根据具体的处罚措施来决定。

综上所述，驾驶证扣分后第二年是否会清零，取决于扣分的具体情况以及驾驶员是否在一个记分周期内有所记分。因此，建议驾驶员在驾驶过程中严格遵守交通规则，避免不必要的扣分和处罚。如果有任何疑问或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。