祖坟被别人破坏了，赔偿问题需从物质损失和精神损害两个方面综合考虑，以下是详细的解答：
一、物质损失赔偿
赔偿内容：
- 物质损失赔偿主要包括坟墓本身的修复费用，例如墓碑、墓穴等因破坏造成的损坏重置成本，以及可能涉及的重新安葬相关物品的费用。
赔偿金额确定：
- 赔偿金额通常需要通过专业评估机构对修复费用及重新安葬费用进行核算，以确保赔偿数额的准确性和合理性。对于轻度破坏，若修复费用经过权威机构评估证实是合理且必需的，则按照评估结果支付赔偿金；若祖坟破坏程度严重到无法修复，需重新安葬，则应参照相关丧葬费用标准给予适当赔偿。
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百八十四条，侵害他人财产的，应按照损失发生时的市场价格或其他合理方式计算赔偿。
二、精神损害赔偿
赔偿内容：
- 挖祖坟行为对逝者近亲属会造成严重的精神痛苦和心理创伤，因此有权要求精神损害赔偿。
赔偿金额确定：
- 精神损害赔偿金额由法院综合考虑侵权行为的恶劣程度、影响范围、亲属的精神痛苦程度以及侵权人的经济能力等因素来判定。
法律依据：
- 《中华人民共和国民法典》第九百九十六条及《最高人民法院关于确定民事侵权精神损害赔偿责任若干问题的解释》第二条均规定，因侵权行为造成严重精神损害的，受害人有权请求精神损害赔偿。
三、赔偿争议解决方式
- 协商解决：双方可通过自行沟通，就赔偿事项达成一致意见，这是最为灵活和便捷的方式。
- 调解解决：若协商不成，可请求有关部门或人民调解委员会进行调解，以促使双方达成赔偿协议。
- 诉讼解决：若协商和调解均无法解决争议，逝者近亲属可向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担相应的民事赔偿责任，包括物质损失赔偿和精神损害赔偿，并通过法律途径解决赔偿问题。
四、法律责任
- 民事责任：挖别人祖坟的行为构成侵权，侵权人需依法承担民事赔偿责任。
- 行政责任：情节严重的挖坟行为可能违反《中华人民共和国治安管理处罚法》，侵权人将面临行政处罚。
- 刑事责任：在某些情况下，挖坟行为可能触犯刑法中的相关规定，如盗窃、侮辱尸体罪，需承担刑事责任。
综上所述，若祖坟被别人破坏，权益人有权依法提出赔偿要求，并可通过协商、调解或诉讼等方式解决赔偿争议。同时，侵权人也需承担相应的法律责任。建议尊重他人的合法权益和民族风俗习惯，避免此类侵权行为的发生。