中医研究院义诊时售卖仪器是否合法，需分情况讨论，具体如下：
若义诊活动合法且售卖仪器符合相关规定：
- 义诊合法性：中医研究院作为医疗机构，若其举办的义诊活动经过了卫生行政部门的备案或审批，且活动内容符合医疗卫生管理法规的要求，那么该义诊活动本身是合法的。
- 售卖仪器合法性：在义诊过程中售卖仪器，需确保所售卖的仪器属于合法医疗器械，且研究院具备相应的医疗器械经营资质。同时，售卖行为应遵守《医疗器械监督管理条例》等相关法规，包括但不限于确保仪器的质量、安全性、有效性，以及提供必要的说明书、标签和警示信息等。若研究院能够满足这些条件，那么售卖仪器的行为也是合法的。
若义诊活动或售卖仪器存在违法情形：
- 义诊违法：如果中医研究院未经过卫生行政部门的备案或审批，或者义诊活动内容违反了医疗卫生管理法规，如进行非法行医、夸大宣传等，那么该义诊活动就是违法的。在此情况下，售卖仪器的行为也可能因义诊活动的违法性而受到影响，被视为非法行为。
- 售卖仪器违法：即使义诊活动本身合法，但如果研究院售卖的仪器不属于合法医疗器械，或者研究院不具备相应的医疗器械经营资质，或者售卖行为违反了《医疗器械监督管理条例》等相关法规，如销售未经注册、无合格证明文件、过期、失效、淘汰的医疗器械等，那么售卖仪器的行为就是违法的。
法律后果与建议：
- 法律后果：若中医研究院在义诊过程中售卖仪器存在违法情形，可能面临卫生行政部门的处罚，包括但不限于警告、罚款、没收违法所得、责令停业整顿等。同时，如果售卖的仪器给患者造成了损害，研究院还可能承担民事赔偿责任，甚至刑事责任。
- 建议：中医研究院在举办义诊活动并售卖仪器时，应确保活动的合法性和售卖仪器的合规性。具体来说，应提前向卫生行政部门备案或审批义诊活动，确保活动内容符合法规要求；同时，应确保所售卖的仪器属于合法医疗器械，并具备相应的经营资质和合规手续。如有任何疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见。