结论：签合同两份都留在甲方，这一行为本身并不直接构成违法，但其合法性及潜在风险需结合具体情况分析。以下从不同角度为你详细阐述：

1. 合同份数与留存方的法律意义

   • 合同的份数通常由双方协商确定，法律并未强制规定合同必须一式几份或各自留存。因此，从合同份数的角度来看，两份合同都留在甲方并不直接违反法律规定。
   • 然而，合同是双方意思表示一致的产物，每一份合同都应视为双方对合同内容的确认。如果两份合同都留在甲方，而乙方没有留存，这可能在实践中给乙方带来不便，如需要证明合同内容或履行情况时可能缺乏直接证据。

2. 合同留存方的潜在风险

   • 对甲方而言：虽然两份合同都留在甲方看似掌握了主动权，但这也可能带来管理上的风险。例如，如果甲方不慎丢失或损毁合同，可能面临无法证明合同内容或履行情况的风险。此外，如果合同中存在对甲方不利的条款，甲方单独留存合同也可能成为乙方主张权利的依据。
   • 对乙方而言：乙方没有留存合同可能面临更大的风险。在合同履行过程中，如果发生争议或纠纷，乙方可能因缺乏合同证据而处于不利地位。例如，如果甲方否认合同中的某些条款或拒绝履行合同义务，乙方可能难以提供有效证据来支持自己的主张。

3. 建议与措施

   • 双方协商：在签订合同时，双方应就合同的份数和留存方进行充分协商，并明确约定在合同中。这样可以避免后续因合同留存问题产生的争议。
   • 各自留存：为了保障双方的权益，建议双方各自留存一份合同。这样，在合同履行过程中，如果发生争议或纠纷，双方都可以提供合同证据来支持自己的主张。
   • 备份与保管：无论合同由哪方留存，都应做好备份和保管工作。可以采取电子备份和纸质备份相结合的方式，确保合同的安全性和可追溯性。

4. 特殊情况下的法律考量

   • 如果合同中涉及敏感信息或商业秘密，双方可能需要在合同中约定保密条款，并明确合同留存方的保密义务。在这种情况下，即使两份合同都留在甲方，甲方也应承担相应的保密责任。
   • 如果合同受到特定法律法规的监管（如金融合同、房地产合同等），双方应遵守相关法律法规的规定，确保合同的合法性和有效性。在这种情况下，合同份数和留存方可能受到特定限制或要求。

总结与进一步思考：签合同两份都留在甲方并不直接违法，但可能带来管理上的风险和双方权益的不平衡。为了保障双方的权益和避免后续争议，建议双方在签订合同时就合同的份数和留存方进行充分协商，并各自留存一份合同。如果你在合同签订或履行过程中遇到任何法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。