在合同中书写“五千元”时，为确保合同的严谨性和避免潜在的纠纷，建议采用以下方式：
明确金额大小写：在合同中同时使用阿拉伯数字和中文大写数字来书写金额，以防止金额被篡改。对于“五千元”，可以写作“人民币伍仟元整（¥5,000.00）”。其中，“人民币伍仟元整”是中文大写金额，“¥5,000.00”是阿拉伯数字金额，两者相互印证，提高金额的准确性和安全性。
注意金额的表述方式：在合同中，金额的表述应当清晰、准确，避免使用模糊或易产生歧义的词汇。例如，不要使用“约”、“大概”等词汇来描述金额，以免给合同的执行带来不必要的麻烦。
考虑金额的支付方式和时间：在合同中，除了明确金额外，还应注明金额的支付方式和时间。例如，可以约定“乙方应在本合同签订后XX日内，向甲方支付人民币伍仟元整（¥5,000.00）”。这样的约定有助于明确双方的权利和义务，减少合同纠纷的发生。
遵循相关法律法规和合同规范：在书写合同金额时，还应遵循相关法律法规和合同规范的要求。例如，根据《中华人民共和国合同法》等相关法律法规的规定，合同中的金额应当真实、合法、有效，不得存在欺诈、胁迫等情形。同时，合同中的金额表述也应符合行业惯例和合同规范的要求。
总结：在合同中书写“五千元”时，建议采用“人民币伍仟元整（¥5,000.00）”的表述方式，并注意金额的支付方式和时间、遵循相关法律法规和合同规范的要求。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。