公司只发基本工资是否合法，需根据具体情况进行综合判断。以下是从不同角度的详细分析：

合法情况

1. 劳动合同或规章制度明确约定：

   • 如果劳动合同中明确规定了在某些特定情形下（如业绩不达标、企业经营困难等），公司可以只发放基本工资，且该约定不违反法律法规的强制性规定，同时基本工资不低于当地最低工资标准，那么这种做法是合法的。
   • 例如，合同中约定：“在公司业绩连续两个季度未达预期时，员工工资将调整为基本工资，直至公司业绩恢复。”若此约定合法且员工知晓并同意，公司在此情况下只发基本工资即合法。

2. 特殊情况下的协商与同意：

   • 在遇到不可抗力因素（如自然灾害、政府行政命令等）或公司确实面临严重经营困难时，如果公司与工会或职工代表大会协商一致，并向员工说明情况，只发基本工资通常是被允许的。
   • 例如，公司因疫情导致业务停滞，与员工协商后决定暂时只发放基本工资以共渡难关，且此决定经过民主程序并公示，那么这种做法是合法的。

不合法情况

1. 无故降低工资：

   • 没有任何合同约定或法定理由，公司单方面决定只发基本工资，降低员工的工资待遇，这是不合法的。
   • 例如，公司突然通知员工：“从下个月开始，只发放基本工资，不再发放绩效工资。”若此决定未与员工协商且无合理依据，则构成违法。

2. 绩效考核不合理：

   • 虽然公司声称因绩效考核不达标而只发基本工资，但绩效考核标准不明确、不合理，或者考核过程不公正、不透明，缺乏充分的事实依据来证明员工未达到绩效要求，这种做法也是违法的。
   • 例如，公司设定的绩效考核标准模糊不清，且考核过程中存在主观臆断，导致员工被不公正地扣减工资，那么这种做法是不合法的。

3. 低于最低工资标准：

   • 即便劳动合同中只约定了基本工资，用人单位在实际支付过程中也需确保基本工资不低于当地的最低工资标准。如果基本工资低于这一标准，同样是不合法的。
   • 例如，当地最低工资标准为2000元/月，而公司只发放1500元/月的基本工资，那么这种做法是不合法的。

劳动者权益保护

1. 协商与投诉：

   • 面对公司只发基本工资的不合法行为，劳动者首先应与公司进行协商解决，要求其按照劳动合同约定支付足额工资。
   • 协商不成时，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，寻求政府的帮助和支持。劳动监察部门会依法对公司进行调查和处理。

2. 劳动仲裁与诉讼：

   • 如果协商和投诉均无法解决问题，劳动者可以选择提起劳动仲裁或诉讼来维护自身的合法权益。
   • 在此过程中，劳动者应保留好相关证据（如劳动合同、工资条、考勤记录、绩效考核表等），以便在仲裁或诉讼中提供有力的支持。

总结与建议：公司只发基本工资的合法性取决于多种因素的综合考量。劳动者在面对此类问题时，应首先了解自己的权益和劳动合同中的相关约定；其次，与公司进行协商并保留好相关证据；最后，在协商无果的情况下及时寻求法律援助或提起劳动仲裁/诉讼以维护自己的合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。