结论：员工辞职时工资是否应该当天结清，并非由法律强制统一规定必须当天结清，但依据《工资支付暂行规定》的精神，用人单位应在解除或终止劳动合同时尽快且一次性全额结算员工的工资。具体是否当天结清，需根据双方约定、公司规定及实际情况来确定。
法律分析
法律依据：
- 根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这一规定明确了用人单位在劳动合同终止时的工资支付责任，即应尽快且一次性支付。
实际操作中的常见情形：
- 当天结清：在管理规范、财务流程简单的企业，尤其是小型企业或服务业企业中，员工辞职时工资可能会当天结清。这种方式有助于减少后续纠纷，体现用人单位的管理规范性。
- 按公司常规发薪日结清：若无特别约定，用人单位通常按照公司平时的发薪日期来支付工资。例如，若公司每月15号发放上月工资，员工月中辞职，则工资可能在下个月15号发放。但用人单位需确保在合理时间内支付，避免无故拖欠。
- 存在争议或特殊情况时延迟结清：若双方对工资数额、加班情况、经济赔偿或罚款等事项存在争议，或因公司财务流程限制、工作需要核算等特殊情况，工资可能无法在辞职当天结清。此时，公司应与员工协商确定一个合理的支付时间，并以书面形式明确告知员工具体的支付日期。
员工权益保护：
- 如果公司无故拖延或拒绝支付辞职员工的工资，员工有权采取多种措施维护自身权益，包括向当地劳动监察部门投诉或向劳动争议仲裁委员会提出申诉。
- 除了工资结算问题，员工在辞职时还可能涉及经济补偿金、未休年假、加班工资等其他权益的结算。这些都需要根据具体情况和相关法律法规进行妥善处理。
综合建议
- 公司层面：公司应建立健全的离职员工工资结算制度，确保在解除或终止劳动合同时能够尽快且一次性全额结算员工的工资。如遇特殊情况需延迟支付，应及时与员工沟通并书面明确支付时间，以避免不必要的纠纷。
- 员工层面：员工在辞职时应了解自己的合法权益，包括工资结算、经济补偿金等其他权益的结算。如遇公司拖延或拒绝支付的情况，应积极采取措施维护自身权益，如与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。
示例说明：假设小张在一家公司工作，因个人原因决定辞职。在辞职前，小张与公司就工资结算问题进行了沟通。公司表示，由于财务流程限制，无法在辞职当天结清工资，但承诺会在下一个发薪日（即下个月15号）将工资全额支付给小张，并出具了书面确认。小张同意了公司的安排，并在辞职后按时收到了工资。这个例子说明了，在双方协商一致的情况下，工资结算时间可以灵活安排，但公司需确保在合理时间内支付工资。
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