结论前置：伤残鉴定的部门选择需根据伤残的具体原因来确定，不同原因对应的鉴定部门和流程也有所不同。以下是针对不同伤残原因的详细解答。
工伤伤残鉴定
- 鉴定部门：由设区的市级劳动能力鉴定委员会负责。该委员会由社会保险行政部门、卫生行政部门、工会组织、经办机构代表以及用人单位代表共同组成。
- 适用情况：职工在工作过程中因工作原因受伤或患职业病，需要进行伤残鉴定以确定伤残等级，进而处理工伤赔偿等事宜。
- 申请流程：职工发生工伤后，经治疗伤情相对稳定且存在残疾、影响劳动能力的，或停工留薪期满（含延长期限），应及时向市级劳动能力鉴定委员会提出鉴定申请。申请时需提供工伤认定决定和职工工伤医疗的相关资料。
交通事故伤残鉴定
- 鉴定部门：具备资质的司法鉴定机构。这些机构需通过省级司法行政机关审核并取得《司法鉴定许可证》。
- 适用情况：因道路交通事故造成的人体损伤，需要进行伤残鉴定以确定伤残程度，进而进行事故赔偿。
- 申请流程：通常在治疗终结后，由当事人或其代理人委托有资质的司法鉴定机构进行鉴定。也可在诉讼过程中，由人民法院指定鉴定机构。申请时需提供病历、诊断证明、影像学资料等相关材料。
人身损害伤残鉴定（非工伤、非交通事故）
- 鉴定部门：同样为具备资质的司法鉴定机构。
- 适用情况：除工伤、交通事故外的其他原因导致的人身损害，如打架斗殴、意外伤害等，需要进行伤残鉴定。
- 申请流程：可由当事人自行委托或在提起诉讼后，由法院委托司法鉴定机构进行。自行委托时，应选择合法资质、信誉良好的鉴定机构，并提供身份证明、病历资料、事故证明等相关材料。
医疗事故伤残鉴定
- 鉴定部门：首次鉴定由设区的市级地方医学会或省、自治区、直辖市直接管辖的县（市）地方医学会组织；再次鉴定由省、自治区、直辖市地方医学会组织；疑难、复杂且在全国有重大影响的案件，可由中华医学会组织。
- 适用情况：医疗事故中造成的人身损害，需要进行伤残鉴定以确定医疗行为是否存在过错、医疗行为与损害后果之间是否存在因果关系及患者伤残程度。
- 申请流程：医患双方协商解决医疗事故争议时，如需技术鉴定，应共同委托医学会组织鉴定。卫生行政部门接到相关报告或申请后，认为需要技术鉴定的，也应交由医学会组织。申请时需提供病历资料、医疗事故争议相关证据等。
通用建议：
- 在进行伤残鉴定前，务必明确伤残原因，以便选择正确的鉴定部门。
- 提前电话咨询相关机构，了解具体的鉴定流程、所需材料及费用等信息，确保准备充分。
- 若对鉴定结果有异议，应及时按照法定程序提出复议或重新鉴定申请。
注意事项：
- 无论哪种伤残鉴定，申请人都应提前准备好病历、影像资料（如X光片、CT片等）以及其他相关医疗证明文件。
- 同时，还需提供身份证明文件，如身份证、户口本等。
希望以上解答能帮助您明确伤残鉴定的部门选择及相关流程。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。