结论前置：协商解除劳动合同后，若存在特定情形，劳动者仍然可以申请劳动仲裁来维护自身权益。但需注意，仲裁申请需在法定时效内提出，且若双方已真实、合法地完成协商并履行完毕，一般不得再就同一事项申请仲裁。
可以申请仲裁的情况
存在欺诈、胁迫或乘人之危等情形
- 法律解释：根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十六条，以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下订立或者变更劳动合同的，该劳动合同无效或者部分无效。这意味着，如果劳动者在协商解除劳动合同过程中受到欺诈、胁迫或乘人之危，其签订的解除协议可能被视为无效，劳动者有权申请仲裁来维护自身权益。
- 实例说明：假设用人单位在协商解除劳动合同时，隐瞒了即将发放的奖金或福利，诱使劳动者签订解除协议。劳动者在发现后，可以主张欺诈，并申请仲裁要求恢复劳动关系或获得相应的经济补偿。
协商解除协议未履行或未完全履行
- 法律解释：如果协商解除劳动合同后，用人单位未按照协议约定履行义务，如未支付经济补偿金、未办理离职手续等，劳动者可以依据协议申请仲裁，要求用人单位履行支付义务或办理相关手续。
- 实例说明：劳动者与用人单位协商解除劳动合同，并约定用人单位支付一定数额的经济补偿金。但用人单位在劳动者办理离职手续后，未按照约定支付经济补偿金。此时，劳动者可以申请仲裁，要求用人单位支付经济补偿金及可能的滞纳金。
涉及未明确协商的劳动争议事项
- 法律解释：劳动争议受案范围包括因劳动合同订立、履行、变更、解除等发生的争议。如果协商解除劳动合同时，未涉及某些劳动争议事项，如加班工资、未休年假补偿等，劳动者在离职后可以就这些事项单独申请仲裁。
- 实例说明：劳动者与用人单位协商解除劳动合同，但协商过程中未提及加班工资问题。劳动者在离职后，发现用人单位未支付其在职期间的加班工资，此时可以申请仲裁，要求用人单位支付加班工资及可能的加班费加付赔偿。
不可以申请仲裁的情况
- 协商解除劳动合同是双方真实意思表示，且协议已明确权利义务并履行完毕：如果协商解除劳动合同是双方平等自愿、协商一致的结果，且协议内容合法合规，双方已按照协议约定履行了各自的义务，劳动者通常不得再就同一事项申请仲裁。例如，双方平等自愿协商解除劳动合同，用人单位按约支付了补偿金，劳动者也办理了离职手续且无其他争议声明，此时劳动者再申请额外补偿一般不会被支持。
注意事项
- 时效限制：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者在发现自身权益受到侵害后，应及时申请仲裁，以免超过时效期间而丧失维权机会。
- 证据收集：在申请仲裁前，劳动者应尽可能收集并保留相关证据，如劳动合同、解除协议、工资单、加班记录、沟通记录等，以证明自己的主张。这些证据将在仲裁过程中发挥重要作用，有助于劳动者维护自身权益。
总结与建议：协商解除劳动合同后，劳动者是否可以申请仲裁取决于具体情况。在符合法定条件时，劳动者有权申请仲裁以维护自身权益。但同时也应注意遵守时效规定，确保申请的合法性及有效性。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。