合作社存款能否追回需视具体情况而定，主要取决于合作社的性质、资金去向、法律关系及证据情况等因素。以下分情况详细说明：

1. 若合作社为合法登记的农民专业合作社，且资金被非法侵占或挪用
   根据《农民专业合作社法》第六条及《刑法》第二百七十二条，若合作社管理人员或成员通过虚构债务、转移资产、私分资金等方式非法占有合作社财产，可能构成职务侵占罪或挪用资金罪。此时，存款人可通过以下途径追回资金：

   • 刑事报案：向公安机关经侦部门报案，通过刑事追赃程序追回损失；
     
   • 民事诉讼：以合作社为被告，要求返还被侵占的资金（需证明资金属于合作社财产且被非法处置）；
     
   • 行政投诉：向农业农村部门举报合作社违规行为，由行政部门介入调查。

2. 若合作社因经营不善破产或解散
   根据《企业破产法》及《农民专业合作社法》相关规定，合作社破产时需按法定顺序清偿债务：

   • 优先清偿顺序：职工工资、社保费用、税款等；
     
   • 普通债权清偿：存款人作为债权人，需在破产程序中申报债权，按比例参与分配剩余资产。
     注意：若合作社资产不足以清偿全部债务，存款人可能无法全额追回存款。

3. 若合作社未依法登记或以合作社名义非法集资

   • 非法集资情形：若合作社以高息为诱饵吸收公众存款，但未依法取得金融许可，可能涉嫌非法吸收公众存款罪或集资诈骗罪。此时，存款人需通过刑事报案参与追赃，但追回比例取决于案件侦破情况及资产处置结果。
     
   • 未登记情形：若所谓“合作社”未依法注册，可能被认定为个人或团体非法行为，存款人需通过民事诉讼起诉实际控制人，要求返还资金（需证明资金交付事实及对方过错）。

4. 关键证据与程序建议

   • 证据收集：保留存款凭证、合作社章程、资金往来记录、会议决议等文件，证明资金归属及合作社违规行为；
     
   • 程序选择：根据资金性质（存款/投资/借款）选择合适法律途径（如刑事报案、民事诉讼或破产债权申报）；
     
   • 时效限制：民事诉讼时效为3年，刑事报案无时效限制但需尽早行动以防止资产转移。

行动建议：

1. 立即梳理资金往来证据，明确合作社性质及资金用途；
   
2. 咨询专业律师评估案件性质，制定刑事追赃、民事诉讼或破产债权申报策略；
   
3. 若涉及非法集资，尽快向公安机关报案并配合调查。
   

如有进一步细节（如合作社登记状态、资金去向等），可提供更多信息以便精准分析。