关于员工迟到1小时应如何计算扣款的问题，这并非由法律直接规定具体的扣款金额，而是主要取决于您所在用人单位的内部规章制度。以下是我为您详细梳理的解答：

一、规章制度有明确规定的情况

1. 合法有效的规章制度：

   • 如果您的单位有明确的规章制度，并且该制度已经按照法定程序（如经职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定）制定，同时向您进行了公示或告知，那么单位有权在合理范围内按照该制度执行扣款。

2. 扣款标准的合理性：

   • 规章制度中规定的扣款金额应当合理。根据《工资支付暂行规定》，即使因您本人原因给单位造成经济损失，单位每月扣除的部分也不得超过您当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。迟到通常不被视为直接给单位造成经济损失的情形，因此扣款金额不宜过高。

3. 具体扣款方式：

   • 单位可能根据迟到时间、次数等因素来决定扣款金额。例如，有的单位规定迟到一小时扣除当日工资的一定比例（如10%-20%），也有的单位会按照迟到时间对应扣除相应时长的工资。

二、规章制度无明确规定的情况

• 如果您的单位规章制度中没有关于迟到扣薪的具体规定，那么单位随意扣除工资就缺乏法律依据。在这种情况下，单位扣除工资的行为可能被视为违法克扣工资，您有权要求单位足额支付工资。

三、您的权益保护

1. 知情权与咨询权：

   • 您有权查阅所在单位的规章制度，了解迟到的具体规定和处理方式。如果对相关规定有疑问或不明确的地方，建议咨询单位的人力资源部门或相关负责人以获得准确的解答。

2. 维权途径：

   • 如果单位存在违法克扣工资的情况，您可以先与单位协商解决；协商不成的，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

综上所述，员工迟到1小时的扣款金额主要取决于您所在单位的规章制度。为了保障自己的权益，建议您了解并熟悉单位的规章制度，并在发生争议时依法维护自己的合法权益。