工程合同只盖章没签字，在大多数情况下是有效的，但具体效力需结合实际情况和相关法律法规来判断。以下从多个角度进行详细分析：
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条的规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。这表明，盖章与签字在法律上具有同等的效力，都是对合同内容的确认和认可。因此，对于工程合同而言，只要合同上加盖了合法有效的公章，如公司的公章或合同专用章，且盖章主体具备相应的民事行为能力和合同签订资格，那么即使没有法定代表人或授权代表的签字，合同通常也是成立并有效的。
印章的有效性：
- 所盖的章必须是真实且合法有效的。如果印章是伪造的或存在其他问题，如过期、未备案等，那么合同的效力将会受到严重影响。因此，在签订合同前，务必确认对方所使用的印章是否真实有效，并符合相关法律法规的要求。
合同约定：
- 部分工程合同中可能会明确约定“合同自双方签字且盖章之日起生效”。在这种情况下，如果只盖章而没有签字，那么合同可能并未满足约定的生效条件，从而可能导致合同不生效。因此，在签订合同时，应仔细阅读合同条款，确保了解并满足合同的生效条件。如果合同中有此类约定，建议同时完成签字和盖章手续，以避免潜在的法律风险。
特殊情况下的合同无效性：
- 如果盖章是通过非法手段获取的，或者盖章主体存在欺诈、胁迫等违法行为，这些都将影响合同的真实性和合法性，可能导致合同被认定为无效。此外，如果合同内容违反法律法规的强制性规定，如涉及违法建筑、违反环保法规等，也会导致合同无效。因此，在签订工程合同时，应确保合同内容合法合规，并避免使用非法手段获取印章。
实际操作建议：
- 为避免未来可能出现的纠纷，建议在签订工程合同时尽量同时签字和盖章。如果合同明确要求盖章，则应确保双方均完成盖章手续。同时，对于合同中的各项条款和细节也应仔细审查，特别是关于合同生效条件、违约责任等关键条款，以确保合同的完整性和法律效力。
举例说明：
- 假设甲公司与乙公司签订了一份工程合同，合同中并未明确约定必须签字且盖章才生效。甲公司在合同上加盖了合法有效的公章，但乙公司仅由授权代表签字而未盖章。在这种情况下，由于合同未明确约定必须盖章，且甲公司已加盖公章表示认可合同内容，因此该合同通常会被认定为成立并有效。
- 反之，如果合同中明确约定了“合同自双方签字且盖章之日起生效”，而乙公司仅签字未盖章，且甲公司对此提出异议，那么该合同可能因未满足约定的生效条件而不生效。此时，双方应协商补充盖章手续或重新签订合同以明确双方的权利义务。
综上所述，工程合同只盖章没签字在大多数情况下是有效的，但具体效力需结合实际情况和相关法律法规来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。