叔叔和侄子做亲子鉴定，在正常情况下，他们的基因相似度并不会达到亲子关系的标准，而是会体现出旁系亲属的相似度。以下从几个方面进行详细解释：

1. 亲子鉴定与亲属关系鉴定的原理：

   • 亲子鉴定主要是通过比较父母与子女之间的基因位点，来确定是否存在生物学上的亲子关系。它依赖于基因的遗传规律，即子女会从父母那里继承一半的基因。
   • 亲属关系鉴定，如叔叔与侄子之间的鉴定，则是通过比较他们之间的基因相似度，来推断是否存在特定的亲属关系。这种鉴定同样基于基因的遗传和变异规律，但考虑的是旁系亲属之间的基因共享情况。

2. 叔叔与侄子的基因相似度：

   • 叔叔和侄子之间共享一部分基因，这部分基因来自于他们的共同祖先（即叔叔的父亲，也是侄子的祖父）。然而，由于叔叔和侄子分别从共同祖先那里继承了不同的基因组合，因此他们的基因相似度不会达到亲子关系的水平。
   • 亲子鉴定中，父母与子女之间的基因相似度通常非常高，接近100%（在排除基因突变的情况下）。而叔叔与侄子之间的基因相似度则显著降低，具体数值取决于多种因素，包括基因的遗传方式、变异率等。

3. 亲子鉴定结果的解读：

   • 如果进行叔叔与侄子的亲子鉴定（实际上更准确地说是亲属关系鉴定），结果通常会显示他们之间存在一定的基因相似度，但不足以证明他们是亲子关系。
   • 亲子鉴定机构会出具详细的报告，说明鉴定对象之间的基因相似度以及可能存在的亲属关系。在叔叔与侄子的鉴定中，报告会明确指出他们之间是旁系亲属关系。

4. 实际应用中的考虑：

   • 在某些特殊情况下，如父亲无法参与亲子鉴定时，可能会考虑使用叔叔的基因样本作为参考。然而，这种情况下需要谨慎解读结果，因为叔叔与侄子之间的基因相似度并不足以直接证明亲子关系。
   • 如果需要进行正式的亲属关系确认（如继承权确认、户籍登记等），建议咨询专业的法律或遗传学机构，以获取更准确和可靠的鉴定结果。

总结来说，叔叔和侄子做亲子鉴定（实际为亲属关系鉴定）时，他们的基因相似度会体现出旁系亲属的特征，而不足以证明亲子关系。如果你对这方面有进一步的疑问或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。