长期旷工单位是可以开除员工的，但这一行为必须严格遵循相关法律法规及单位规章制度的规定。以下是对此问题的详细解答：

一、法律依据

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条：劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。长期旷工通常被视为严重违反用人单位规章制度的行为之一。
2. 《中华人民共和国劳动法》第二十五条：劳动者严重违反劳动纪律或者用人单位规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。这同样为用人单位因员工长期旷工而解除劳动合同提供了法律依据。

二、单位规章制度的要求

1. 制定程序合法：单位的规章制度必须经过职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定，确保民主程序的履行。未经法定程序制定的规章制度，不能作为开除员工的依据。
2. 内容明确合理：规章制度中应明确界定旷工的定义、严重程度以及相应的纪律处分措施。例如，规定连续旷工几天或累计旷工几天属于严重违纪，并明确此类行为将导致解除劳动合同。同时，规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定。
3. 公示与告知：单位必须将规章制度明确告知员工，通过员工手册发放（需有签收记录）、培训（留存培训资料）或会议传达（有会议纪要）等方式，确保员工充分知晓相关规定。

三、事实认定与证据收集

1. 旷工行为的确认：单位应有充分的证据证明员工存在旷工行为。这包括但不限于考勤记录（如打卡记录、签到表）、工作安排记录以及相关沟通记录等。证据应真实、完整且能够相互印证。
2. 严重性评估：在确认旷工行为后，单位还需评估该行为的严重性是否达到规章制度所规定的“严重违反”程度。这通常涉及对旷工天数、次数以及对员工工作态度和单位秩序的影响等方面的综合考虑。

四、开除程序与注意事项

1. 批评教育与改正机会：在开除员工前，单位应给予员工批评教育，并视情况给予改正的机会。这既体现了单位的人性化管理，也有助于减少劳动争议的发生。
2. 开除决定的作出与送达：开除决定应由单位依法定程序作出，并确保决定的合法性、合理性以及公正性。决定作出后，应及时送达给员工，并告知其享有的权利和救济途径。
3. 通知工会：根据《劳动合同法》第四十三条的规定，用人单位单方解除劳动合同，应当事先将理由通知工会。工会认为用人单位违反法律、法规和有关合同，要求重新研究处理时，用人单位应当研究工会的意见，并将处理结果书面通知工会。
4. 避免违法开除：单位应严格遵守法律法规和规章制度的规定，避免因程序违法或事实不清而导致违法开除。否则，单位可能面临支付赔偿金等法律责任。

五、经济补偿问题

若用人单位依法依规解除劳动合同，通常无需支付经济补偿金；但若存在违法解除的情况，如未按照法定程序通知工会、未给予员工改正机会等，则可能面临支付赔偿金的风险。赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍。

举例说明：假设某单位规章制度中明确规定，连续旷工3天或一年内累计旷工5天属于严重违纪行为，单位有权解除劳动合同。某员工连续旷工4天，单位在调查取证、通知工会并听取员工申辩后，决定解除劳动合同。此时，单位的行为是合法的，无需支付经济补偿金。但如果单位未通知工会或未给予员工申辩机会，则可能构成违法解除，需要支付赔偿金。

总结与建议：长期旷工单位是可以开除员工的，但必须确保规章制度的合法性、事实认定的准确性以及开除程序的合法性。作为员工，应严格遵守单位的规章制度，避免旷工等违纪行为的发生；作为单位，应完善规章制度，加强员工管理，确保在解除劳动合同时做到合法合规。如果您在劳动纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。