针对您提出的“病假结束后不能胜任工作怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，当员工病假结束后，如果确实因为健康原因不能胜任原工作，公司应当采取一系列合理且合法的措施来处理这一问题。
第一步：确认员工状况
公司应首先与员工进行沟通，了解其健康状况和不能胜任原工作的具体原因。建议要求员工提供医疗证明或相关医生的建议，以书面形式确认其“不能从事原工作”。
第二步：另行安排工作
在确认员工不能从事原工作后，公司应根据员工的实际情况和公司的岗位需求，为其另行安排合适的工作。这一安排应充分考虑员工的身体状况、技能特长和职业发展意愿，确保新工作既不会对员工的健康造成进一步影响，也能使其发挥所长。
第三步：通知员工上班并确认
公司应书面通知员工到新岗位上班，并要求员工确认是否能够从事新安排的工作。如果员工继续请假不来上班，或者明确表示不能从事新工作，那么这构成了“不能从事由用人单位另行安排的工作”。
第四步：根据法律规定处理
如果双方无争议：根据《劳动合同法》第四十条第一项规定，公司可以提前三十日以书面形式通知员工本人，或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。同时，公司应当依法支付相应的经济补偿。
如果双方存在争议：如果员工或公司对是否能够从事原工作或新工作存在争议，可以根据当地规定进行劳动能力（复工）鉴定。根据鉴定结果，如果员工被鉴定为不能从事任何工作，公司可以按照相关规定解除劳动合同，并支付相应的经济补偿和医疗补助费。
第五步：支付医疗补助费（如适用）
根据《关于实行劳动合同制度若干问题的通知》等相关规定，如果劳动者因患病或非因工负伤，在合同期满或医疗期满后被解除劳动合同，公司应当支付不低于六个月工资的医疗补助费。对于患重病或绝症的员工，还应适当增加医疗补助费。
总结与建议：
在处理病假结束后不能胜任工作的问题时，公司应始终遵循合法、合理、人性化的原则。与员工进行充分沟通，了解其实际需求和困难；根据员工的实际情况和公司的岗位需求，为其另行安排合适的工作；如果确实无法继续履行劳动合同，应按照法律规定支付相应的经济补偿和医疗补助费。同时，公司也可以考虑为员工提供必要的职业康复支持或转岗培训，帮助员工尽快恢复健康并重新融入职场。