针对您提出的“员工离职车辆有违章不配合处理怎么办”的问题，这确实是一个需要细致处理的情况。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确车辆违章的处理时限以及可能产生的后果。车辆违章主要分为非现场违法和现场违法两种情况：

1. 非现场违法：

   • 这类违章通常是由道路上设置的违法监控设备记录或违法停车被贴条记录的。
   • 驾驶人只需在下次验车前将非现场违法处理完毕即可，处理前不会产生滞纳金。

2. 现场违法：

   • 这类违章是由交通民警为违法行为人现场开具处罚决定书（罚单）的。
   • 现场违法在民警开具出罚单时，已直接记入到违法行为人名下。
   • 违法行为人需要在15日内缴纳罚款，否则每日会按罚款金额的百分之三加处罚款，但加处罚款总额不超过罚款数额。

针对您的情况，如果员工离职后车辆有违章且不配合处理，您可以采取以下措施：

1. 与员工沟通：

   • 首先尝试与离职员工进行友好沟通，解释违章的严重性以及可能产生的法律后果，包括滞纳金、影响个人信用记录等。
   • 询问员工不配合处理的原因，并尝试协商解决方案，如员工自行处理违章或公司协助处理但员工承担相关费用。

2. 公司内部处理：

   • 如果沟通无果，公司可以考虑先行垫付违章罚款及相关费用，并保留相关凭证。
   • 同时，公司应完善内部管理制度，明确员工离职时车辆违章的处理流程和责任归属，以避免类似情况再次发生。

3. 法律途径：

   • 如果员工仍然拒绝配合处理，且公司认为有必要追究其法律责任，可以向相关部门（如交通管理部门、劳动仲裁机构或法院）寻求帮助。
   • 提供相关证据（如违章记录、员工离职证明、沟通记录等），以支持公司的主张。

4. 预防措施：

   • 在未来，公司可以在员工入职时明确车辆使用规定和违章处理责任，要求员工签署相关协议。
   • 定期对员工进行交通安全教育，提高员工的交通安全意识和法律意识。

综上所述，处理员工离职车辆违章问题需要综合考虑沟通、公司内部处理、法律途径以及预防措施等多个方面。希望这些建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。