关于单位使用微信转账发放工资是否违法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要综合考虑多个方面的因素。以下是我为您提供的详细分析：
一、法律层面的分析
合法性基础：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。这里的“货币形式”并未明确排除电子支付手段，如微信转账。
- 随着科技的发展，电子支付已成为普遍接受的支付方式，因此，从法律条文本身来看，微信转账发放工资并不直接构成违法。
合规性要求：
- 工资支付需通过正规渠道进行，以确保可追溯性和安全性。微信转账虽然便捷，但相较于银行转账，它缺乏银行流水等正式记录，这可能在劳动纠纷中影响证据效力。
- 企业应遵守《工资支付暂行规定》，采用符合规定的支付方式（如银行代发），并保留完整的支付记录至少两年备查。微信转账可能难以满足这一要求。
二、实际操作中的风险
税务监管问题：
- 微信转账难以直接关联企业账户，可能导致个人所得税申报与实际收入不符，从而引发税务风险。
- 企业若未依法代扣代缴税款，将违反《税收征收管理法》，可能面临补缴税款、罚款等处罚。
劳动关系认定争议：
- 非正规支付方式可能模糊雇佣关系的边界，特别是在劳务外包或临时工场景中，这可能影响工伤赔偿、社保缴纳等权益的归属。
资金安全风险：
- 个人微信账户无企业账户的资金托管功能，可能出现款项被挪用、延迟到账等问题。
- 电子支付平台的技术故障或网络攻击也可能造成工资发放中断。
举证困难隐患：
- 在劳动仲裁或诉讼中，微信转账记录可能因易被质疑真实性而面临举证困难。相比之下，银行流水具有更强的法律效力。
三、建议与最佳实践
优先采用银行代发：
- 通过企业对公账户直接转账至员工银行卡，既符合监管要求，又能自动生成可查询的流水记录，便于管理和举证。
完善财务管理制度：
- 若确需使用微信转账，企业应建立健全的财务制度，对工资支付进行规范化管理，包括明确的支付流程、记录保存和税务申报。
- 同时，应与员工签订书面协议，明确支付方式及双方的权利义务，以降低法律风险。
增强法律意识：
- 劳动者也应关注自己的工资支付方式，确保权益得到保障。在签订劳动合同时，应明确工资支付方式及相关条款。
法律咨询与合规审查：
- 在采用任何非传统工资支付方式前，建议企业咨询专业法律顾问，进行合规性审查，以防范潜在的法律风险。
综上所述，虽然微信转账发放工资本身不直接构成违法，但存在诸多潜在的法律风险和管理问题。因此，从合规性和风险管理的角度出发，建议企业优先采用银行转账等正式渠道发放工资。