结论：周末不加班扣绩效是否合法，主要取决于公司的具体规定、劳动合同中的相关条款，以及这些规定和条款是否符合《中华人民共和国劳动法》等法律法规的要求。一般情况下，未经协商的周末不加班扣除绩效可能构成违法；但在特殊情况下或公司有合法且明确的规定时，扣除可能具有合理性。以下从不同角度进行分析：
加班的法律规定
根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要加班，需与工会和劳动者协商一致，且不得违反每日及每月的加班时间限制。这表明，劳动者有权拒绝未经协商的加班要求。绩效作为对员工工作表现的一种评价，其发放条件和标准应由公司规章制度或劳动合同明确规定。如果公司规章制度或劳动合同中未明确规定“周末不加班就扣除绩效”，或者该规定违反了法律法规（如侵犯了劳动者的合法权益），则公司不能随意扣除员工的绩效。
特殊情况下的加班
根据《中华人民共和国劳动法》第四十二条，存在自然灾害、事故等紧急情况，或生产设备故障等必须及时抢修的情形时，用人单位可以不受加班时间限制的安排加班。在这些特殊情况下，如果劳动者无正当理由拒绝加班，公司根据合法且明确的规章制度扣除绩效可能具有一定合理性。但即便如此，公司也需确保扣除绩效的规定不违反法律法规，且已向劳动者明确告知。
劳动者的权益保护
如果劳动者认为公司不合理地扣除了绩效，应首先与公司进行沟通协商，要求其纠正违法行为。若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或申请仲裁时，劳动者需提供相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工资条等，以证明公司扣除绩效的行为违法。
实际操作建议
审查劳动合同和公司规章制度：劳动者应仔细审查自己的劳动合同和公司规章制度，了解公司关于加班和绩效发放的具体规定。如果发现公司规定违反法律法规或侵犯了自己的合法权益，应及时与公司沟通协商。
保留相关证据：劳动者应保留与加班和绩效发放相关的证据，如加班记录、工资条、公司通知等。这些证据在后续维权过程中将起到重要作用。
寻求法律帮助：如果劳动者认为自己的权益受到侵害，且无法与公司协商解决，可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为劳动者提供法律咨询和代理服务，帮助劳动者维护自己的合法权益。
总结：周末不加班扣绩效是否合法，需根据具体情况判断。劳动者应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当的措施来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。