针对农村巷子被占的问题，这是一个涉及土地使用权、规划合规性以及邻里关系等多方面的复杂情况。以下是我为您提供的详细、有条理的解决方案：
一、确认占地情况与巷子产权
收集证据：
- 您需要首先确认建房者是否确实占用了巷子，并收集相关证据，如土地使用权证、房产证（如果涉及私有土地）、现场照片或视频等，以证明占地事实。
核实巷子产权：
- 向村委会咨询并查阅相关规划图纸、土地台账等资料，明确巷子的土地性质，确认其是否属于村集体公共用地或已纳入村庄建设规划。
- 若巷子有明确的产权归属，如属于某个邻居或村集体，则需进一步了解产权情况，为后续协商或法律行动做准备。
二、尝试沟通协商与调解
与建房者直接沟通：
- 尝试以平和、理性的方式与建房者沟通，指出其占用巷子带来的不便和可能引发的法律问题，探讨双方都能接受的解决方案，如调整建房位置、共同出资扩建巷子等。
请求村委会调解：
- 若直接沟通无果，可请求村委会介入调解。村委会作为基层自治组织，对当地土地情况和邻里关系有深入了解，能够公正协调双方利益，提出更贴合实际的解决方案。
三、采取行政途径解决
向乡镇政府投诉：
- 若村委会调解未能解决问题，您可向乡镇政府的相关部门（如国土所、规划办等）投诉，并提供收集到的证据。乡镇政府有责任对农村建房行为进行监管，并将依法调查处理占用巷子的情况，如责令停止建设、限期改正或拆除违法建筑。
向自然资源部门反映：
- 若占用巷子涉及土地权属问题或违反土地利用规划，您还可向当地自然资源部门反映。该部门会调查核实并依法处理，包括可能进行的行政处罚或要求恢复原状。
四、考虑法律诉讼手段
提起民事诉讼：
- 若巷子的占用影响了您的通行、排水等相邻权益，您可以相邻权纠纷为由向人民法院提起民事诉讼。根据《民法典》的相关规定，要求建房者排除妨碍、恢复原状，并赔偿因占地给您造成的损失。在诉讼中，您需提供充分证据支持自己的主张。
提起行政诉讼（如适用）：
- 若乡镇政府等行政部门对建房占用巷子的问题不作为或处理不当，您还可向人民法院提起行政诉讼，要求行政部门依法履行职责。但需注意，行政诉讼程序相对复杂，且需有充分证据证明行政部门的违法行为或不作为。
五、预防与长期建议
遵守规定：
- 在农村地区建房前，应提前了解并严格遵守当地的土地规划和建设规定，避免因违规建设而引发纠纷。
加强沟通：
- 加强村民之间的沟通与协调，共同维护村集体的公共利益和和谐氛围。在建房前与邻居充分沟通，确保建房行为不会侵犯他人的合法权益。
关注村庄规划：
- 关注村庄的长期规划和发展方向，确保自己的建房行为符合村庄的整体利益和发展需求。
综上所述，处理农村巷子被占的问题需要综合考虑多个方面，包括确认占地情况与巷子产权、尝试沟通协商与调解、采取行政途径解决、考虑法律诉讼手段以及预防与长期建议。希望这些建议能对您有所帮助，并祝您顺利解决问题。